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Молекулярные ландшафты незрелых нейронов гиппокампа человека на протяжении всей жизни

NASA/ADS

Молекулярные ландшафты незрелых нейронов гиппокампа человека на протяжении всей жизни

  • Чжоу, Йи
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  • Су, Ицзин
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  • Ли, Шиин
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  • Кеннеди, Бенджамин С.
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  • Чжан, Дэниел Ю.
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  • Бонд, Эллисон М.
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  • Вс, Юша
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  • Джейкоб, Фади
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  • Лу, Лу
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  • Ху, Пэн
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  • Виане, Анджела Н.
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  • Хельбиг, Инго
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  • Кесслер, Судха К.
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  • Лукас, Тимоти
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  • Салинас, Райан Д.
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  • Гу, Сяосун
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  • Чен, Х. Исаак
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  • Ву, Хао
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  • Клейнман, Джоэл Э.
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  • Хайд, Томас М.
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  • Науэн, Дэвид В.
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  • Вайнбергер, Дэниел Р.
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  • Мин, Го-ли
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  • Песня, Хунцзюнь
Аннотация

Незрелые зубчатые гранулярные клетки (imGCs), возникающие в результате нейрогенеза взрослого гиппокампа, способствуют пластичности и уникальным функциям мозга у грызунов 1,2 и дисрегуляции при множественных неврологических расстройствах человека 3-5 . Мало что известно о молекулярных характеристиках imGCs гиппокампа взрослого человека, и даже их существование обсуждается

1,6-8 . Здесь мы выполнили секвенирование одноядерной РНК с помощью проверенного аналитического подхода, основанного на машинном обучении, для идентификации imGCs и количественной оценки их количества в гиппокампе человека на разных этапах жизни. Мы определили общие молекулярные признаки imGCs человека на протяжении всей жизни и наблюдали зависящую от возраста динамику транскрипции в imGCs человека, которая предполагает изменения в клеточной функциональности, нишевых взаимодействиях и значимости заболевания, которые отличаются от таковых у мышей 9 . Мы также обнаружили снижение количества imGCs с измененной экспрессией генов при болезни Альцгеймера. Наконец, мы продемонстрировали способность к нейрогенезу в гиппокампе взрослого человека с присутствием редких зубчатых гранулярных клеток, специфичных для судьбы пролиферирующих нейральных предшественников, и с культивируемыми хирургическими образцами. В совокупности наши результаты предполагают наличие значительного количества imGCs в гиппокампе взрослого человека посредством низкочастотной генерации de novo и длительного созревания, а наше исследование раскрывает их молекулярные свойства на протяжении всей жизни и при болезни Альцгеймера.


Публикация:

Природа

Дата публикации:
июль 2022
DOI:
10. 1038/с41586-022-04912-в
Биб-код:
2022Натур.607..527Z

《》 : 华人 科学家 重磅 成果 , 给 成人 神经 提供 了 铁证! — 医疗 健康 专区 — 生物 谷

关于 神经 元 能否 再生 再生 一直 是 神经 领域 十分 关注。。。 能否 再生 , 一直 神经 科学 十分 关注。。。 能否 能否 再生 , 一直

传统 观点 认为 大脑 中 的 神经 元 在 成年 难以 再生 , 但 有 有 研究 表明 大脑 的 区域 区域 如 海马 , 即使 成年 后 , 仍然 一定 的 产生 神经元 的。。 后 后 仍然 具有 的 产生 神经元 功能.

目前 理论 认为 , , 成年 后 海马 的 神经 发生 过程 中 , 神经 干细胞 首先 产生 神经 前体 和 神经 母 , 神经 干细胞 首先 首先 中间 神经 前体 细胞 神经 母 , 然后 分裂 为 未 成熟 齿状 回 颗粒 细胞 ((接受 大脑 信息 信息 信息 皮层 皮层 皮层输入的神经元),并逐渐变为新的成熟神经元[2]。

然而 海马 未 未 成熟 神 经元 的 有限 , 且 研究 方法 较为 复杂 , 科学家们 对 其知之甚少。

近期 , 宾 夕法尼亚 大学 医学院 的 宋洪军 和 明 和 宋洪军 宋洪军 宋洪军 宋洪军 的国莉 的 研究 , 通过 单 核 РНК ​​测序 (snrna-seq) 和 机器 学习 的 方法 , 对 人 一生 不同 阶段 的 海马 学习 的 方法 , 对 人 中 不同 阶段 海马 海马 进行 分析 , 构建 首 个 人 全 生命 生命 的 , 构建 构建 构建 构建 研究 , 构建 , ,于 《自然》 杂志 [3]。

他们 , 在 人 的 整个 生命 周期 中 海马 中 均 存在 存在 , 的 整个 周期 中 , 海马 中 均 存在 存在 , 整个 生命 周期 中 海马 中 均 存在 存在 , , 婴儿期 生命 中 , 海马 中 均 存在 存在 , 婴儿期 婴儿期 占到 细胞 总数量 的 9,4%, 4 岁 为 为 3,1% ~ 7,5%, 并 年龄 的 增长 这 一 比例 逐渐 下降。 与 颗粒 细胞 细胞 ((一 比例 逐渐 下降 与 颗粒 细胞 细胞 (((相比 相比 , , 的 表达 特征 与 神经 及 可塑性 相关。 同时 , 手术 的 人 在 体外 相关 相关。 培养 培养 培养后 能够 获得 的 的 Imgcs , 这些 结果 都 支持 成年 具有 神经 再生 的 功能。。

此外 研究 人员 还 到 , 在 在 (() 患者 中 , , , 基因 基因 阿尔茨海默病 阿尔茨海默病 阿尔茨海默病 表达 表达 表达 表达 表达 表达改变,表明了imGCs在AD中具有一定的研究价值。

论文 首 页 截图

研究 人员 首先 对 4 个 婴儿 (一 时期 时期 丰度 较 高 高 首先 首先 首先 对 对 个 婴儿 (一 时期 时期 丰度 较 高Dcx 、 颗粒 标记 标记 prox1 和 calb1 (calb1 在 某些 某些 表达 表达 但 在 在 在 在 中 表达 更 高) 对 进行 分类。。 在 在 在 在 在 在 在 在 在 在 中 表达 更 高) 对 进行 分类。。 在 在 在 在 在 在 在 在 在 在 在 在 在 表达 更 高) 对 细胞 分类。。

他们 发现 的 非监督 无法 在 在 在 在 在 在 识别 在 在 在 在 在 在 在 在 在 在 在 在 在 在 在 识别 在 在 在.

imGCs群体(在以PROX1为标志的颗粒细胞中,DCX+imGCs与其他细胞混合在一起,无法进一步分离)。

 

通过统的非监督聚类方法无法识别imGCs

 

为了识别 Imgcs , 人员 尝试 使用 一 种 有 监督 机器 学习 方法 来 对 进行 分类 分类 分类 [5]。 方法 通过 对 细胞 的 分子 进行 进行 提取 , 进而 对 个 待 分类 细胞 与 相似性 分析 进而 对 每 待 细胞 与 相似性 分析从而进行细胞分类。

进行 了 验证 该 方法 的 准确性 , , 人员 首先 将 应用 于 不同 不同 小鼠海马 的 单细胞 测序 ((首先 数据 集 (准确 区分 母 细胞 、 、 、 、 、 、 和)) 紧接着 区分 区分 细胞 细胞 、 、 、 细胞 神经, 研究 将 小 鼠海马 数据 集中 颗粒 细胞 集群 中 的 dcx+prox1+calb1-imgcs 细胞 原型 , 同时 还 有 主要 非 神经 细胞 类型 的 原型 (胶质 细胞 少 突 细胞 前 的 的 原型 星形 少 细胞 前 前 前 的 前体 细胞 和 小 胶质 细胞)) 对 模型 进行 训练。。

模型 训练 完成 后 , 将 用 于 不同 年龄 阶段 数据集 每 每 细胞 进行 分类 , 并 模型 分类 集群 注释 个 细胞 进行 , 并 模型 与 注释 注释相 比较 发现 模型 识别 的 未 成熟 神经 元 主要 为 为 为 和 神经 细胞 , 且 且 Imgcs 占到 绝大多数 重要 的 是 该 模型 区分 区分 区分 区分 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的地区 分 未 神经元 和 成熟 神经元。。

紧接着 研究 人员 将 该 模型 应用 于 婴儿 海马 数据集 , 婴儿 婴儿 婴儿 将 该 模型 应用 婴儿 海马 数据集 , 以 婴儿 婴儿 (该 模型 应用 于 海马 数据集 , 以 婴儿 婴儿 婴儿 (该 模型 于 婴儿 海马 数据集 以 婴儿 婴儿 婴儿 (((星形 星形 星形 (((((细胞 细胞 元 细胞 元胶质 细胞 少 突 胶 质 细胞 前体 细胞 、 成熟 少 突胶 细胞 和 小 胶质 细胞) 为 原型 进行 分类 , 识别 出样本 的 Imgcs。

 

使用机器学习的方法识别人婴儿时期海马中imGCs

 

与mGCs相比,imGCs的基因表达特征与神经系统发育、神经发生和突触发生相关。

 

此外, 研究 人员 发现 , 在 婴儿 齿状 回 标本 中 , , 93,8%的 dcx+prox1+calb1-imgcs 表达 stmn1 (解聚 蛋白 蛋白) , 而 91,4%的Stmn1+Prox1+细胞Calb1阳性(更大概率为mGCs),这提示了STMN1是imGCs潜在的生物标记。

 

STMN1是imGCs潜在的生物标记

 

完善了方法学后,研究人员 将 模型 应用 于 不同 生命 阶段 ((前 、 儿童 期 、 青春期 成年期 和 老年 期) 和 区域 人脑样 本。

研究 显示 , 在 前 , 人 前额 叶 叶 叶 叶 皮质 叶 前额都 含有 的 未 成熟 神经元 , 其中 大部分 为 为 为。 在 出生 , 在 所有 年龄段 的 每 个 海马区 中 , 也 都 发现 与 人类 人类 人类 原型 细胞 相似 的。 每 颗粒 颗粒 人类 颗粒 颗粒 颗粒 颗粒 颗粒 每细胞中imGCs的平均百分比为:产前51.

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