Исо расшифровка: ИСО — Международная организация по стандартизации — Главная

Содержание

Сертификат ИСО — что это, виды, как получить, цена, оформление

Под сертификацией ИСО понимается определенный набор стандартов, востребованность которых проявляется при создании и модернизации систем, направленных на обеспечение менеджмента качества. Такие системы гарантируют, что все этапы производства или оказания услуг будут должным образом проконтролированы. Здесь имеется в виду контроль полного набора составляющих подобных процессов: документация, материалы, ресурсы и т. д.

Наши специалисты помогут быстро получить сертификат ИСО. Вы предоставляете минимальный пакет документов и мы приступаем к работе без предоплаты. За 9 лет оформили 23 000 документов для 5 800 компаний России, Беларуси и Казахстана.

Сертификация упомянутых систем признается рыночным инструментом, обладающим высокой эффективностью. Авторитет ИСО на международном рынке не вызывает сомнений, поэтому выдаваемые этой организацией сертификаты воспринимаются с точки зрения бесспорных свидетельств качества продукции (услуги).

Сертификация ИСО служит подтверждением тому, что производимая продукция или оказываемые услуги находятся в полном соответствии с теми стандартами качества, которые учитываются во всем мире. Непосредственно сама сертификация обеспечивается независимым экспертом. Успешное ее проведение, если соответствие стандартам подтверждается, заканчивается выдачей сертификата ISO.

Реализуемый вид сертификации многократно подтвердил свою эффективность, что привело к его самому широкому распространению по миру. В России также действительны сертификаты ИСО. Они признаны на уровне национальных стандартов, используемых для оценки систем менеджмента.

Предприятия, получающие сертификаты ISO, создают для себя определенный набор преимуществ, что повышает их конкурентность на рынке:

поднятие эффективности практически всех бизнес-процессов на фоне снижения издержек производства. Последнее достигается благодаря уменьшению количества пересечений деятельности, когда наблюдается дублирование процессов;
изменение подхода к самому менеджменту за счет придания системе управления нужной мотивированности;
изменение продукции (услуги) с позиции роста ее качества;
оптимизация процессов производства, ведущая к уменьшению потерь из-за низкого качества продукции или откровенного брака;
повышение дисциплинированности сотрудников и их ответственности за рабочий процесс;
перевод предприятия в режим функционирования на основе мировых стандартов;
улучшение позитивного восприятия организации со стороны инвестиционных компаний;
рост благожелательности потребителей и экспансия на рынки сбыта;
возможность вывода продукции (услуги) на рынок Западной Европы;
достижение уровня мировых цен.

Менеджмент качества – это гарантия, что будут соблюдены требования, нормы и стандарты, способные обеспечить необходимое управление компанией. Именно в этом случае могут помочь сертификаты ИСО, отличающиеся универсальностью применения.

Виды сертификатов ISO

Среди принятых на территории России стандартов ISO наиболее распространены следующие:

ИСО 9000 – указания руководящего характера, направленные на использование и выбор конкретной системы менеджмента качества (СМК) на основе параметров, определяющих функционирование компании. Сертификат серии включает в себя основные положения, введение в систему и словарь терминов, применяемых в стандарте этого вида;
ИСО 9001 – четко прописанные и жесткие требования, соблюдение которых возлагается на поставщиков продукции (услуг). Устанавливаются нормы применительно ко всем этапам выпуска продукции: разработка, проектирование, производство, поставка, монтаж и обслуживание. Соответствие стандарту подтверждается контрольными проверками и сертификацией продукции;
ИСО 9002 – устанавливаются требования к поставщикам. Они должны обеспечивать определенную степень эффективности производственного процесса. Выпуск качественной продукции (услуг) требует соответствующего подтверждения;
ИСО 9003 – система, соотносимая с минимальными требованиями к поставщику, которые предъявляются на этапе финальных испытаний, при контроле и по итогам сертификации. Этот сертификат обусловливает обязательность проведения испытаний, когда осуществляется приемка конечного продукта, и контроль производственного процесса;
ИСО 9004 – стандартизации СМК, где на первый план выходят нормы и требования по внедрению и разработке таких систем;
ИСО 10012 – стандарт, определяющий нормы, соблюдение которых гарантирует выпуск качественного оборудования в виде средств различных измерений;
ИСО 14001 – требования применительно к системам экологического менеджмента. Их соблюдение вменяется в обязанность предприятия с целью обеспечения защиты окружающей среды от негативных факторов, возникающих во время производственных процессов или в результате оказания услуг. С помощью этого сертификата задаются параметры системы, на основе которых перераспределяется ответственность, осуществляется планирование и управление всем объемом доступных ресурсов, востребованных для реализации экологической программы на должном уровне;
ИСО 19011 – рекомендации, описывающие эффективное функционирование СМК и определяющие нормы проведения программ аудита по отношению к экологическому менеджменту;
ИСО 13485 – требования, предъявляемые к продукции медицинского характера и связанным с ней услугам. Сюда относят этапы проектирования, монтажа, производства и обслуживания;
ИСО OHSAS 18001 – оценка систем менеджмента, обеспечивающих безопасность и охрану труда. Наличие такого сертификата служит подтверждением, что компания проводит широкий спектр мероприятий, направленных на то, чтобы жизнь и здоровье сотрудников не подвергались опасности. Это ощутимо укрепляет репутацию компании;
ИСО 22000:2005 (ХАССП) — система менеджмента в сфере пищевой продукции, которая регулирует стандарты безопасности, а также формирует модель управления и контроля над рисками, которые могут возникать в пищевой промышленности.
Сертификат оценки опыта и деловой репутации — объективный показатель оценки целого ряда факторов, прямо характеризующих уровень доверия к той или иной компании.

Конкретные ИСО включают в себя или все производственные этапы, или только какой-либо один. Вне зависимости от этого задаются нормы, с помощью которых устанавливаются характеристики качества продукции (услуги).

Основные положения ISO определяют разработку соответствующих стандартов, отличающихся тем, что они оказывают эффективное влияние на СМК. Это достигается за счет соблюдения 8 принципов, гарантирующих успешность любого предприятия:

Учет приоритета клиента, базирующийся на его удовлетворенности. Компания должна проявлять интерес к сотрудничеству с конечным потребителем. Требуется постоянный анализ того, насколько он удовлетворен приобретаемой продукцией (услугами).
Понимание важности лидерства руководителя, способного усовершенствовать организационную структуру компании благодаря своим качествам. Обязательно наличие стратегии развития и эффективной системы менеджмента. При этом деятельность сотрудников следует стимулировать с помощью создания соответствующей деловой обстановки.
Способствование активности сотрудников посредством тех или иных стимулов с целью повышения отдачи от их работы на благо компании.
Управление компанией в рамках единой системы, где присутствует полное взаимодействие менеджмента и производства.
Системный поход к функционированию компании, когда устанавливаются четко обозначенные связи между процессами производства и структурными подразделениями.
Непрерывная деятельность по модернизации бизнес-процессов, предполагающая использование оценок качества работы вне зависимости от объекта: должностное лицо или подразделение, что должно соотноситься с обязательным контролем.
Принятие решений управленческого характера, базирующихся на фактических данных. Внесение корректив в управленческую деятельность должно обосновываться реальным положением дел. Только это позволяет принимать единственно верные решения.
Постоянное поддержание отношений с поставщиками на взаимовыгодной основе.

Получение сертификатов ИСО

Первый этап сертификации ИСО предполагает формирование определенного пакета документов, включающего в себя:

заявку, составление которой должно быть проведено в соответствии с установленной формой;
уставные документы компании-заявителя и необходимые реквизиты;
схематическое представление подразделений компании, участвующих в производственном процессе, дополненное информацией относительно их функциональных обязанностей;
состав компании с точки зрения квалификации сотрудников с указанием лица, отвечающего за качество продукции;
лицензии (копии), подтверждающие право компании осуществлять те или иные виды деятельности;
перечень НТД, регламентирующий работу компании.

Получение сертификата ИСО включает в себя подготовительный этап. Необходимо проведение аудита применяемой в компании системы управления. Такая проверка менеджмента позволяет выявить величину несоответствия европейским стандартам. В дальнейшем проводятся мероприятия по реорганизации управления с учетом требований ISO.

После завершения подготовки можно переходить к непосредственному получению сертификата ISO, что основывается на следующем алгоритме:

подача заявления, дополненного требуемым пакетом документов, в сертификационный орган;
изучение предоставленной документации экспертами для понимания того, как именно функционирует система управления компании;
вынесение решения сертификационным органом относительно соответствия СМК компании критериям ISO;
выдача международного сертификата, если все условия удовлетворены.

Сертификация ИСО привносит положительные моменты в деятельность компании, которые укрепляют ее положение на рынке. Повышается качество продукции, что обеспечивается благодаря росту квалификации сотрудников и оптимизации системы менеджмента.

Международная организация по стандартизации ISO

Деятельность международной организации ISO обусловливается выпуском стандартов. Она была основана в 1946 году. Ядром нового проекта стали две компании: ISA и UNSCC. Хотя в общей сложности количество ее участников составило 25 национальных компаний. Российская Федерация заняла свое место в совете ISO в 2005 году.

ИСО занимается разработкой и выпуском стандартов, признаваемых во всем мире. Также эта организация решает проблемы сертификации. ISO стандартизирует практически все области, за исключением электротехники и электроники. Последнее – прерогатива Международной электротехнической комиссии.

Подтверждение соответствия требованиям ИСО распространяется на продукты и услуги, но в большей мере это касается СМК. Такая сертификация проводится исключительно аккредитованными органами, имеющими действительный аттестат, который служит доказательством правомочности их действий. Помимо самой сертификации могут проводиться испытания и инспекции. Положительное завершение этого процесса приводит к выдаче сертификата соответствия. В России сертификация ISO является сугубо добровольным делом.

В любом случае ИСО гарантирует:

уверенность, что потребитель будет иметь доступ к качественной услуге или приобретет товар, который не вызовет нареканий;
эффективность СМК, способствуя этим росту конкурентных преимуществ;
безопасность окружающей среды и сохранение здоровья людей.

Логотип ISO – товарный знак, прошедший положенную регистрацию. Этот факт говорит о том, что его использование невозможно сторонними компаниями и какими-либо лицами. ИСО не дает на это разрешения. Сама организация ISO не осуществляет непосредственные мероприятия по сертификации, поэтому было бы некорректно, если бы ее логотип использовался подобным образом.

Соответствие требованиям ИСО подтверждается уполномоченными органами сертификации, действующими на основе надлежащего аттестата. Именно их логотип может использоваться компаниями, прошедшими сертификацию. Также доступно письменное информирование покупателя о соответствии ISO. Например, это делается с помощью контрэтикетки товара.

Большей популярностью отличается сертификация ИСО применительно к системам менеджмента. Стандарты в этой области разрабатывались долгое время специалистами многих стран. В результате были разработаны нормы, следование которым значительно повышает эффективность деятельности любой компании. Получение такого сертификата ISO не только меняет статус компании, но и способствует получению выгод от применения на практике глобальных наработок в отношении СМК. Вне зависимости от размера, компании учатся более правильному использованию ресурсов, улучшают управление рисками и повышают качество продукции (услуги), что поднимает степень удовлетворенности потребителей.

Почему стоит получить сертификат ИСО

Сертификаты ИСО оказывают положительное влияние на эффективность компании и увеличение прибыли. Их получение предполагает приведение менеджмента к определенному стандарту, следования которому приводит к хорошей результативности, что проверено многократно на практике в разных странах.

ISO способствует облегчению мировой торговли. Следование предлагаемым стандартам разрушает имеющиеся барьеры. Импортная продукция в основном своей массе сертифицируется ИСО. Зарубежные компании активно используют этот метод признания качества товаров (услуг). Если вас интересуют новые рынки за рубежом или вы хотите укрепиться там, где вы находитесь сейчас, то следование международным стандартам поможет вам в этом. В итоге компания способна получить как внутренние, так и внешние преимущества.

Стандарты ИСО | Журнал «Management» всё об ISO 9001

В условиях глобализации бизнеса и торговли, когда даже понятие «кризис» приобретает мировой характер, стремление к постоянному росту и развитию становится наиболее важным и первоочередным. Наиболее перспективные и быстро адаптирующиеся компании, способные проанализировать ситуацию и использовать ее в своих целях, смогут пережить смутные времена и реализовать свои амбиции.

В связи с этим в последнее время возникают вопросы о более эффективном, рациональном управлении, сертификации, о системах управления качеством, о стандарте ISO 9001. Попробуем разобраться в данных вопросах.

ЧТО ТАКОЕ ISO?

Аббревиатура ISO расшифровывается как International Organization for Standardization (Международная Организация по Стандартизации). Это организация, которая является всемирной федерацией национальных организаций по стандартизации.

В переводе с греческого слово «ΙΣΟΣ» (ИСОС) — «равный», вот почему на всех языках мира Международная Организация по Стандартизации имеет краткое название ISO (ИСО).

Участниками ISO сегодня являются более 150 стран мира, каждая из которых представлена национальными организациями по стандартизации. За период существования организации было опубликовано более 17 тысяч международных стандартов в различных областях деятельности. Начало было положено в период бурного подъема производства и, как следствие, мощного развития товарообмена между крупными индустриальными странами; внедрение стандартов приводило к удешевлению продукции, снижению затрат на производство, уменьшению отходов, повышению уровня совместимости продукции, произведенной в разных странах, упрощению ее использования и обслуживания.

ИСТОРИЯ ISO

Первые попытки международной стандартизации были предприняты в 1906г., когда была создана Международная электротехническая комиссия (МЭК) для унификации качества производимой продукции, которая была бы адаптирована к эксплуатации и признана потребителями различных странах мира. Данная международная стандартизация продукции явилась причиной создания в 1946 году международной федерации национальных ассоциаций по стандартизации, названной Международной Организацией по Стандартизации (ISO).

ISO была учреждена в Лондоне, где делегаты 25 стран приняли решение о возобновлении деятельности и создании организации, целью которой является обеспечение международной координации и унификации производственных стандартов.

В настоящее время Центральный секретариат ISO располагается в Женеве (Швейцария).

В 1987 году Международная Организация по Стандартизации выпустила серию норм по качеству, известных как серия ISO 9000, которые были разработаны для того, чтобы помочь организациям всех видов и размеров внедрить и обеспечить функционирование эффективных систем менеджмента, способствующих формированию на предприятиях культуры высокого качества.

КАКИЕ ПРЕИМУЩЕСТВА У МЕЖДУНАРОДНЫХ СТАНДАРТОВ ИСО?

Международные стандарты приносят технологические, экономические и социальные преимущества. Они помогают гармонизировать технические характеристики товаров и услуг, делают отрасль более эффективной и способствуют устранению барьеров в международной торговле. Соответствие международным стандартам помогает убедить потребителей, что продукты являются надежными, эффективными и безопасными для окружающей среды.

ДЛЯ БИЗНЕСА

Международные стандарты — это стратегические инструменты, руководства помогающие компаниям решить некоторые из самых насущных проблем современного бизнеса. Они обеспечивают как можно более высокую эффективность бизнес — операций, повышают производительность и помогают компаниям получить доступ на новые рынки.

Преимущества включают:

Экономия расходов — международные стандарты позволяют оптимизировать операции и, тем самым, улучшают конечный результат
Расширение потребительской удовлетворенности — стандарты помогают улучшить качество, повысить удовлетворенность потребителей и увеличить продажи
Доступ к новым рынкам — стандарты помогают преодолеть торговые барьеры и открывают доступ на мировые рынки
Увеличение доли рынка — стандарты помогают увеличить производительность и конкурентоспособность
Экологические преимущества — стандарты помогают снизить негативное воздействие на окружающую среду

Преимущества в цифрах

2,5 млрд. фунтов стерлингов — годовой вклад стандартов в экономику Великобритании
80% — доля влияния международных стандартов в мировой торговле
100 миллион. австр. долл. — выгода для экономики Австралии от выборочных стандартов в горнодобывающей промышленности
84% снижения сроков транспортировки благодаря контейнерным перевозкам

Стандарт iso 9000:2005 «системы менеджмента качества. Основные положения и словарь»

Стандарт iso 9001:2008 «системы менеджмента качества. Требования»

Стандарт iso 9004:2000 «системы менеджмента качества. Рекомендации по улучшению деятельности»

Стандарт iso 14001:2004 «системы экологического менеджмента. Требования и руководство по их применению»

Стандарт ohsas 18001:2007 «системы менеджмента охраны здоровья и обеспечения безопасности труда. Требования»

Стандарт iso 19011:2002 «руководящие указания по проведению аудитов систем менеджмента качества и/или систем менеджмента окружающей среды»

Стандарт iso 22000:2005 «системы менеджмента безопасности пищевых продуктов. Требования ко всем организациям в цепи производства и потребления пищевых продуктов»

Техническая спецификация iso/ts 16949:2002 «системы менеджмента качества. Особые требования по применению исо 9001:2000 для организаций-производителей серийных и запасных частей для автомобильной промышленности»

Стандарт iso 17025:2005 «общие требования к компетентности испытательных и калибровочных лабораторий»

Стандарт iso 27001:2005 «системы управления информационной безопасностью. Требования»

Техническая спецификация iso/ts 29001:2003 «нефтяная, нефтехимическая и газовая отрасли промышленности. Отраслевые системы менеджмента качества. Требования к организациям, поставляющим продукцию и услуги»

Стандарт iso/ tr 10013: 2001 «рекомендации по документированию систем менеджмента качества»

Стандарт iso/tr 10017:2003 «руководство по статистическим методам применительно к iso 9001:2000»

Стандарт iso 10019:2005 «руководящие указания по выбору консультантов системы менеджмента качества и использованию их услуг»

Стандарты ISO | interstandart

Международная Организации по Стандартизации (ИСО) объединяет национальные организации по стандартизации. Членами ИСО в настоящее время являются более 90 стран. Федеральное агентство по техническому регулированию и метрологии участвует в работе ИСО в качестве национальной организации по стандартизации Российской Федерации.

ФБУ «КВФ «Интерстандарт» заключило лицензионное соглашение с ИСО на право распространения стандартов ИСО на территории РФ, а также на перевод и распространение переводов стандартов ИСО на русском языке.

ФБУ «КВФ «Интерстандарт» предлагает действующие стандарты ISO, поправки к стандартам, отмененные стандарты, проекты и публикации ISO по всем тематикам Международного классификатора стандартов (МКС).

Осуществить поиск и подбор необходимых стандартов ISO Вы можете на официальном сайте организации ИСО: www.iso.org

Стандарты ISO и их переводы распространяются в виде официальных копий, как на бумаге, так и в электронном виде в формате PDF.

Оплата производится по безналичному расчету в рублях на основании выставленного счета.

Стандарты ISO защищены авторским правом. Все права принадлежат организации ISO. Копирование без разрешения правообладателя запрещено!

ПОДРОБНУЮ ИНФОРМАЦИЮ

о стоимости и условиях приобретения стандартов и переводов

Вы можете получить,

направив запрос с перечнем НТД

по e-mail: [email protected]

или по тел.: +7 (499) 236 54 49

Обработка заявки выполняется в течение 2-х рабочих дней

Обновление ценовой информации от 09. 01.2020 г.
При изменении курса валюты стоимость на стандарты может быть скорректирована.

Узнать о наличии готового перевода или определить стоимость заказа перевода стандартов на русский язык

Вы можете, направив запрос по e-mail: [email protected]

Международная Организация по стандартизации (ИСО)

Название «ИСО»
Очень много людей замечают несоответствие между полным официальным названием — International Organization for Standardization, и сокращенным — ISO. Получается, что аббревиатурой организации должно быть IOS. Но ISO — это не аббревиатура.
На самом деле, слово ИСО образовано от греческого слова isos, что означает «равный», служит приставкой iso- и встречается в совокупности терминов, таких как «изометрия» (равное измерение или размеры) и «изономия» (равенство закона или людей перед законом).
Название «ИСО» употребляется во всем мире для обозначения организации, во избежание многочисленных вариаций аббревиатуры, получающихся от перевода «International Organization for Standardization» на различные языки членов организаций, например IOS на английском, OIN на французском (от Organisation internationale de normalisation).

Таким образом, ИСО — сокращенная форма обозначения международной организации в любой стране.

Как все начиналось
Международная стандартизация начиналась с электротехнической области: Международная электротехническая комиссия (International Electrotechnical Commission — IEC) была создана в 1906 году, а первые работы в других областях начали проводиться такой организацией, как International Federation of the National Standardizing Associations (ISA), учрежденной в 1926 году. Особый акцент в рамках ISA был сделан на машиностроение.
Деятельность ISA прекратилась в 1942 году из-за начала Второй Мировой Войны. Вслед за встречей в Лондоне в 1946 году, делегаты из 25 стран решили создать новую международную организацию «целью которой будет развитие международной координации и объединение промышленных стандартов». Новая организация — ИСО — официально начала функционировать в 23 феврале 1947 года.
Первый стандарт ИСО был выпущен в 1951 году и назывался «Standard reference temperature for industrial length measurement».

Стандарты. Что это такое?
Стандарты — это документированные соглашения, содержащие технически условия или другие точные критерии, которые обычно используются как правила, принципы или определение характеристик для гарантии того, что материалы, продукты, процессы и услуги соответствуют своему назначению.
Например, формат кредитных карт, телефонных карт и «смат» карт разрабатывался в ИСО Международные Стандарты. Соблюдение стандарта, который определяет такой параметр, как оптимальная толщина (0,76 мм), означает, что карты могут использоваться по всему миру.
Таким образом, международные стандарты упрощают жизнь, увеличивают надежность и эффективность товаров и услуг.

внедрение в России и зарубежный опыт

Начнём с расшифровки аббревиатуры ISO, которая давно у многих на слуху, но о значение прописных латинских букв известно далеко не всем. ISO расшифровывается как International Organization for Standardization, в переводе на русский язык — Международная организация по сертификации.

История создания Международной организации по сертификации началась в 1946 году, но разработка методов регулирования качества началась намного раньше. Первым о них заговорил Ф. Тейлор, которого по праву называют Основателем научного подхода к управлению качеством. Правда его подход к управлению качеством был достаточно узким: контролировалось лишь качество произведённой продукции, причём выборка контроля была сплошной. Позже управлением качеством стали заниматься специалисты из области математической статистики, самым важным достижением которых стал принципиально новый подход к контролю качества: от сплошного контроля качества выпускаемой продукции перешли к выборочному, а это позволило оценивать качество ещё и процессов, а не только результатов.

Следующим этапом, предвосхищающим появление технических стандартов, стал этап системной организации работ по качеству: управлением качеством становится преимущественным перед его контролем.

С 1946 года ISO стала разрабатывать стандарты практически по всем направлениям деятельности, но лишь в 1987 году были разработаны стандарты серии 9000, популярность и востребованность которых давно обогнали все имеющиеся на сегодня международные стандарты. Секрет популярности стандартов серии ISO 9000 прост: они являются практически универсальными, т.к. в них прописана такая модель системы менеджмента качества, которая подходит к любой организации.

Изменения стандартов ISO, происходящие во второй половине XX века, повлияли на разработку и внедрение стандартов на национальных уровнях, например: DIN — в Германии, UNI — в Италии, DIN BS — в Великобритании, ГОСТ — в Советском Союзе.

В дальнейшем, в связи с всеобщей глобализацией и созданием ВТО, в целях развития международной торговли, национальные стандарты были пересмотрены и приведены в соответствие с международными стандартами ISO.

Международные стандарты совершенствуются, унифицируются, расширяется область их применения. В настоящее время стандарты ISO образуют согласованный комплекс стандартов. Разработаны стандарты менеджмента качества, экологического менеджмента, менеджмента безопасности пищевой продукции и проч. Последнее поколение стандартов менеджмента качества появилось в 2008 г и получило обозначение ISO 9001:2008.

Организация, соответствующая требованиям международных стандартов ISO, проходит процедуру сертификации. Сертификат — это документ, подтверждающий соответствие объекта сертификации положениям международных стандартов.
Российская Федерация является членом Международной организации по сертификации.

Обратите вниманиеС 2001 г у нас действуют национальные стандарты ГОСТ Р ИСО 900х-2001, основные положения которых повторяют положения стандартов ISO. К сожалению, российский сертификат не действует за пределами России. Поэтому для выхода Организации на международную арену, для признания её продукции иностранными потребителями, необходимо получить сертификат ISO.

Сертификаты серии ISO наши организации получают на добровольной основе.

Получение международного сертификата даёт преимущество отечественным компаниям, работающим на экспорт. В последнее время всё больше и больше российских организаций прибегают к процедуре добровольной сертификации по стандартам ISO. Объектами такой сертификации в настоящее время являются системы менеджмента, работы, услуги, производство, продукция.

В настоящее время стандарты ISO используются во многих европейских странах и в США, не так давно международная сертификация получила распространение также в Китае. Наибольшую популярность сертификация ISO получила в Европе: доля компаний, получившая международный сертификат, составляет более 80%.

В России процесс получения организациями международных сертификатов стремительно развивается, и на сегодняшний день, по некоторым данным, в нашей стране количество сертифицированных Компаний превышает 50 тысяч.

Автор: юрист Мария Борисенко

Оставьте заявку и наши
специалисты свяжутся с вами
Функциональные подсистемы ИСО «Орион»
ИСО «Орион»
Охранная сигнализация, пожарная сигнализация, автоматическая система пожаротушения, контроль доступа, видеонаблюдение и видеоконтроль, управление инженерными системами зданий, сбор и обработка информации.
Охранная сигнализация
микропроцессорный анализ сигнала в шлейфах сигнализации, возможность измерения резких изменений сопротивления шлейфа для предотвращения саботажа
независимый контроль в одном шлейфе контакта тревоги и контакта блокировки датчика
защита от ложных срабатываний сигнализации за счет высокого напряжения в шлейфах сигнализации (24 В), цифровой фильтрации сигналов сети переменного тока, импульсных наводок, электростатических воздействий и других электромагнитных помех
автоматический сброс тревоги извещателей с питанием по шлейфу при взятии под охрану
речевое предупреждение дежурного на АРМ «Орион Про» о возможном саботаже шлейфов сигнализации при изменении сопротивления шлейфа на определенную величину при взятии его под охрану
разнообразные способы взятия под охрану/снятия с охраны
протоколирование всех событий, происходящих в системе
отображение состояний зон, разделов, точек доступа,приемно-контрольных приборов, считывающих устройств, видеокамер на графических планах помещений
механизм задания полномочий по взятию/снятию и доступу для персонала и посетителей путем программирования уровней доступа
гибкое разграничение полномочий дежурных и администраторов АРМа за счет многоуровневой системы паролей и возможность подключения биометрических систем ограничения доступа к программам АРМ
мощная поддержка макроязыка сценариев управления, позволяющих выдавать одну или комплекс команд приемно-контрольным приборам, исполнительным устройствам, а также программному обеспечению системы как по событию в системе или временному расписанию, так и по команде оператора
речевое оповещение по тревогам, возможность записи и воспроизведения пользовательских речевых сообщений
многоступенчатая обработка тревог
вывод информационных карточек по каждому элементу системы, а также по персоналу или посетителям
защита системы от запуска несанкционированных программ
Пожарная сигнализация
распознавание двойной сработки извещателей в одном шлейфе
защита от ложных срабатываний путем автоматического перезапроса извещателей, питаемых по шлейфу
подключение пороговых, адресных и адресно-аналоговых извещателей
измерение значений запыленности, задымленности и температуры и графическое отображение статистики на экране компьютера
набор статистики для выработки мер повышения пожарной безопасности, организации технического обслуживания
наглядное отображение на планах помещений расположения извещателей и приборов, самых задымленных извещателей, температуры в контролируемых точках, статистики за день, месяц, год
программирование сценариев для управления АСПТ, оповещения
Автоматическая система пожаротушения
автономная или централизованная противопожарная защита объектов промышленного и гражданского назначения по одному направлению газового, аэрозольного или порошкового пожаротушения
контроль состояния шлейфов пожарной сигнализации, цепей датчиков давления, цепей датчиков состояния дверей, цепей датчиков ручного пуска
контроль исправности цепей запуска на обрыв и короткое замыкание
запуск и контроль срабатывания модулей автоматических средств пожаротушения
временная задержка перед пуском средств пожаротушения
дистанционный запуск средств пожаротушения по команде с пульта «С2000М»
ручной запуск средств пожаротушения от датчиков ручного запуска
автоматический запуск средств пожаротушения при срабатывании двух пожарных извещателей в одном либо в нескольких шлейфах сигнализации
включение звукового и светового пожарного оповещения (сирена, транспаранты)
контроль исправности цепей оповещателей на обрыв и короткое замыкание
управление технологическим оборудованием (приводы клапанов систем вентиляции и дымоудаления)
блокировка автоматического пуска при открытии дверей в защищаемое помещение
ручной (с панели прибора «С2000-АСПТ») или дистанционный (с пульта «С2000М» или «С2000-ПТ») сброс режима запуска средств пожаротушения
управление контрольно-пусковыми блоками «С2000-КПБ» для увеличения числа контролируемых цепей запуска
передача служебных и тревожных сообщений на пульт «С2000М» и «С2000-ПТ»
управление двумя или тремя пожарными насосами
управление жокей-насосом или устройством компенсации
управление электрозадвижкой или секцией дренчерной завесы
блокировка автоматического пуска при отключении автоматического режима на любом из шкафов управления насосами
Контроль доступа
управление от ключей Touch Memory, Proximity-карт или PIN-кода
возможность использования одной и той же Proximity карты или ключа Touch Memory для взятия под охрану/снятия с охраны и управления доступом несколькими способами:
децентрализованно: с помощью клавиатуры, с помощью ключа Touch Memory, с помощью дистанционных пластиковых карт
комбинированным способом (клавиатура плюс дистанционная карта)
централизованно: с помощью пульта «С2000», «С2000М», с помощью пульта «С2000-КС», с помощью компьютера
централизованное и распределенное (локальное) хранение ключей доступа
функции контроля повторного прохода Anti-Passback
ограничение доступа по дате и времени
энергонезависимый календарь
поиск сотрудников
учет рабочего времени
отчеты по оставшимся в помещениях на текущее время
низкие затраты в расчете на одну точку доступа
Видеонаблюдение и видеоконтроль
применение IP видеокамер
вывод видео на экран
детекция движения
планирование областей при применении детектора
запись видео на жесткий диск и его просмотр, поиск по дате, времени, номеру камеры
запись пред- и после- тревожных ситуаций с возможностью настройки времени записи
возможность создания удаленных рабочих мест
управление наклонно-поворотными устройствами камер и предустановками (PTZ)
«живое» видео, сравнение видеоизображения с камеры с изображением из базы данных на одном экране при поднесении карты доступа
реагирование системы на самые разнообразные события: от тревоги и предоставления доступа до удаленного управления постановкой на охрану
интеграция видеосистем других производителей с АРМ «Орион Про»
Управление инженерными системами зданий
измерение значений аналоговых параметров (температура,влажность, задымленность)
управление системами кондиционирования, отопления, вентиляции, оповещения, аварийной сигнализации
программирование сценариев для управления инженерными системами зданий как по результатам измерений, событиям в системе или временному расписанию, так и по командам оператора
Сбор и обработка информации
формирование единого информационного пространства
долговременное хранение информации о событиях с возможностью последующей расшифровки и анализа
взаимодействие между системами в тревожных и других ситуациях
комплексное предоставление информации оперативному дежурному и ответственным лицам
разграничение полномочий ответственных лиц при принятии решений и доступу к информации
наличие гибкой системы отчетности с широким набором шаблонов
поддержка единой технологии администрирования базы данных
сокращение затрат на обучение операторов и повышение эффективности их работы за счет использования единого интерфейса
поддержка интерфейсов для взаимодействия с внешними системами
автоматизированный контроль работы системы
Система Экологического Менеджмента ISO 14001
Главная / Система Экологического Менеджмента ISO 14001 | ГОСТ Р ИСО 14001-2016
Система Экологического Менеджмента
В этой статье мы расскажем Вам об ISO 14001: что это такое, зачем он нужен и как его применять в бизнесе. Прочитав это Вы поймете, что данный стандарт обеспечивает не только экологический результат, но и результат финансовой выгоды для организации, деятельность которой построена на основе принципов ISO 14001.

Что такое ISO 14001?
ISO 14001 (Система Экологического Менеджмента, СЭМ) – это инструмент, который позволяет контролировать экологическое воздействие фирмы на окружающую среду, при необходимости сокращая его до минимума.
Общая направленность ISO 14001 — способствовать охране окружающей среды и предотвращению ее загрязнения в балансе с удовлетворением социально-экономических потребностей (например, получении прибыли).
Основная задача ISO 14001 – создание системы экологического менеджмента.

Что такое Система Экологического Менеджмента?
Система Экологического Менеджмента (СЭМ) – это часть общей системы менеджмента, направленная на разработку, внедрение и оценку достигнутых результатов экологической политики, целей и задач организации. Она включает:
организационную структуру

планирование деятельности

распределение ответственности

практическую работу

процедуры, процессы и ресурсы

СЭМ подразумевает последовательное совершенствование всех экологических процессов, степень которой определяется самой организацией.

Преимущества Системы Экологического Менеджмента
Имиджевые
Выполнение нормативных требований проверяющих организаций, клиентов и акционеров

Дополнительное конкурентное преимущество при участии в тендерах, торгах и аукционах

Производственные
Создание экологически чистого и безвредного продукта

Повышение производительности

Финансовые
Перенесение затрат из области штрафов и предписаний, выписываемых проверяющими организациями, в область профилактики экологических нарушений;

Сокращению объема отходов, потребляемого сырья и энергопотребления;

Минимизации аварийных ситуаций и их последствий

Даже ограниченная по своим функциям система экологического менеджмента даёт результат: дополнительные финансовые поступления, которые впоследствии окупают затраты на её внедрение.

Ключ к успеху!
Если Вы хотите не только снизить вредное воздействие на окружающую среду, но и получить существенный экономический эффект – Вы приняли правильное решение! Мы готовы оказать Вам содействие и помощь в достижении поставленных целей.
Наши услуги:
Сертификация СЭМ

Консалтинг на всех этапах разработки и внедрения СЭМ

Обучение Ваших специалистов созданию СЭМ

Есть вопросы?
Просто позвоните нам по номеру 8 (495) 777-54-96 и наши эксперты ответят на них.
Заказать звонок

Приказом Федерального агентства по техническому регулированию и метрологии от 29 апреля 2016 г. N 285-ст. межгосударственный стандарт ГОСТ Р ИСО 14001-2016 утвержден и введен в действие в качестве национального стандарта Российской Федерации.
Настоящий стандарт идентичен международному стандарту ISO 14001:2015 «Environmental management systems — Requirements with guidance for use» («Системы экологического менеджмента. Требования и руководство по применению»). Стандарт подготовлен взамен ГОСТ Р ИСО 14001-2007.

Стандарты DIN, ГОСТ, ISO таблица соответствия
DIN, ГОСТ, ISO — Таблица соответствия стандартов
Изображение Стандарт DIN Наименование Аналог ГОСТ Аналог ISO, EN
DIN 1 Штифт конический незакалённый ГОСТ 3129-70 ISO 2339
DIN 7 Штифт цилиндрический, направляющий ГОСТ 3128-70 ISO 2338
DIN 84 Винт с цилиндрической головкой, прямой шлиц ГОСТ 1491-80 ISO 1207
DIN 85 Винт с прямым шлицем ГОСТ 17473-80 ISO 1580
DIN 93 Шайба стопорная ГОСТ 13463-77
ГОСТ 13464-77
DIN 94 Шплинт стальной ГОСТ 397-79 ISO 1234
DIN 95 Шуруп по дереву с полупотайной головкой ГОСТ 1146-80
DIN 96 Шуруп с полукруглой головкой по дереву ГОСТ 1144-80
DIN 97 Шуруп с потайной головкой по дереву ГОСТ 1145-80
DIN 99 Гайка-ручка зажимная
DIN 124 Заклёпка под молоток с полукруглой головкой ISO 1051
DIN 125 А Шайба плоская ГОСТ 11371-78 ISO 7089
DIN 125 В Шайба плоская с фаской ГОСТ 11371-78 ISO 7090
DIN 126 Шайба стальная ISO 7091
DIN 127 Гровер шайба ГОСТ 6402-70
DIN 128 А Шайба стопорная пружинная
DIN 128 В Шайба стопорная пружинная волнистая
DIN 137 А Шайба пружинная
DIN 137 В Шайба пружинная волнистая
DIN 186 Болт к пазам станочным ГОСТ 13152-67
DIN 188 Болт с Т-образной головкой
DIN 258 Штифт конический с резьбовой цапфой ISO 8992
DIN 261 T-болт для пазов
DIN 302 Заклёпка с потайной головкой ISO 1051
DIN 315 Гайка-барашек
DIN 315 Гайка-барашек, округлые лепестки ГОСТ 3032-76
DIN 316 Винт-барашек
DIN 316 Винт барашковый
DIN 404 Винт с отверстиями
DIN 417 Винт установочный с цапфой ГОСТ 1478-93 ISO 7435
DIN 427 Винт установочный ГОСТ 18746-80 ISO 2342
DIN 431 Гайка трубная ГОСТ 8968-75
DIN 432 Шайба с наружным выступом
DIN 433 Шайба под винт ГОСТ 10450-78 ISO 7092
DIN 434 Шайба косая, уклон 8% ГОСТ 10906-78
DIN 435 Шайба косая, уклон 14% ГОСТ 10906-78
DIN 436 Шайба квадратная для деревянных конструкций
DIN 438 Винт установочный с засверленным концом ГОСТ 1477-93 ISO 7436
DIN 439 Гайка низкая ГОСТ 5916-70 ISO 4035
ISO 4036
ISO 8675
DIN 439 Гайка с левой резьбой
DIN 439 Гайка с мелкой резьбой ГОСТ 5916-70 ISO 8675
DIN 440 Шайба увеличенная ГОСТ 6958-78 ISO 7094
DIN 442 Крышка для укупорки закатыванием
DIN 443 Крышка для укупорки вдавливанием
DIN 444 Болт откидной ГОСТ 3033-79
ГОСТ 14724-69
ГОСТ 14725-69
DIN 462 Шайба с внутренним выступом
DIN 463 Шайба стопорная с лапками ГОСТ 13463-77
ГОСТ 13464-77
DIN 464 Винт с накатанной головкой
DIN 465 Винт с накаткой и прямым шлицем
DIN 466 Гайка рифлёная
DIN 467 Гайка с накаткой рифленая
DIN 470 Шайба запорная
DIN 471 Кольцо стопорное наружное ГОСТ 13942-86
DIN 472 Кольцо стопорное внутреннее ГОСТ 13943-86
DIN 478 Винт с квадратной головкой и буртиком ГОСТ 1488-84
DIN 479 Винт установочный с квадратной головкой ГОСТ 1482-84
ГОСТ 1485-84
DIN 480 Винт с квадратной головкой, буртиком и закругленным концом ГОСТ 1486-84
DIN 508 Гайка для Т-образных пазов ISO 299
DIN 525 Шпилька приварная с гайкой ISO 2339
DIN 529 Анкерные болты, формы A, B, D, F
DIN 529 MU Анкерный болт с гайкой, форма С
DIN 546 Гайка круглая шлицевая ГОСТ 10657-80
DIN 547 Гайка с двумя отверстиями на торце
DIN 548 Гайка с радиальными отверстиями ГОСТ 8381-73
DIN 551 Винт установочный с плоским концом ГОСТ 1477-93 ISO 4766
DIN 553 Винт установочный с коническим концом ГОСТ 1476-93 ISO 7434
DIN 555 Гайка шестигранная ГОСТ 5915-70
ГОСТ 5927-70
ГОСТ 10605-94
ГОСТ 15526-70 ISO 4034
DIN 557 Гайка квадратная
DIN 558 Болты с шестигранной головкой ISO 4018
DIN 561 Болт с уменьшенной головкой и цапфой ГОСТ 1481-84
DIN 562 Гайка квадратная низкая
DIN 564 Болт стопорный с коническим концом
DIN 571 Шуруп-болт ГОСТ 11473-75
DIN 580 Рым-болт ГОСТ 4751-73 ISO 3266
DIN 582 Рым-гайка
DIN 601 Болты и гайки ГОСТ 15589-70 ISO 4016
DIN 603 Болт с полукруглой головкой ГОСТ 7802-81 ISO 8677
DIN 604 Болт с усом
DIN 605 Болт с квадратным подголовком ГОСТ 17673-81
ГОСТ 7786-81
DIN 607 Болт с полукруглой головкой ГОСТ 7801-81
DIN 608 Болт с потайной головкой ГОСТ 7786-81
DIN 609 Болт призонный с длинной цапфой
DIN 610 Болт призонный с короткой цапфой
DIN 653 Винт прижимной низкий с накаткой
DIN 660 Заклёпка с полукруглой головкой ГОСТ 10299-80 ISO 1051
DIN 661 Заклёпка с потайной головкой ГОСТ 10300-80 ISO 1051
DIN 662 Заклёпка с полупотайной головкой ГОСТ 10301-80 ISO 1051
DIN 674 Заклёпка с полукруглой низкой головкой ГОСТ 10302-80 ISO 1051
DIN 675 Заклёпка с плоской потайной головкой ISO 1051
DIN 689 Крюк
DIN 703 Кольцо установочное
DIN 705 A Кольцо установочное
DIN 705 B Кольцо установочное
DIN 741 Зажим для троса
DIN 763 Цепь длиннозвенная
DIN 766 Цепь короткозвенная
DIN 787 Винт для Т-образных пазов ISO 299
DIN 792 Болт с цилиндрической головкой
DIN 797 Болт анкерный фундаментный
DIN 798 Гайка анкерная
DIN 835 Шпилька резьбовая ГОСТ 22038-76
DIN 905 Ключ для болтов с внутренним четырёхгранником 11 мм
DIN 906 Пробка резьбовая коническая с внутренним шестигранником ОСТ 2С98-3-73
DIN 908 Пробка резьбовая цилиндрическая с фланцем и внутренним шестигранником ОСТ 2С98-4-73
DIN 909 Пробка резьбовая коническая с шестигранной головкой
DIN 910 Пробка резьбовая с фланцем и шестигранной головкой
DIN 911 Ключ шестигранный ISO 2936
DIN 912 Винт (болт) с внутренним шестигранником ГОСТ 11738-84 ISO 4762
ISO 12474
ISO 14579
DIN 913 Винт установочный с плоским концом ГОСТ 11074-93 ISO 4026
DIN 914 Винт установочный с коническим концом ГОСТ 8878-93 ISO 4027
DIN 915 Винт установочный с цилиндрическим концом ГОСТ 11075-93 ISO 4028
DIN 916 Винт установочный с засверленным концом ГОСТ 28964-91 ISO 4029
DIN 917 Гайка глухая
DIN 920 Винт с уменьшенной цилиндрической головкой и прямым шлицем
DIN 921 Винт с большой плоской головкой и прямым шлицем
DIN 922 Винт с плоской головкой и цилиндрической цапфой
DIN 923 Винт ступенчатый с плоской головкой
DIN 924 Винт с полупотайной головкой с цапфой
DIN 925 Винт с потайной головкой с цапфой
DIN 926 Винт без головки с цапфой
DIN 927 Винт с цапфой
DIN 928 Гайка приварная квадратная
DIN 929 Гайка приварная шестигранная
DIN 931 Болт с неполной резьбой ГОСТ 7798-70
ГОСТ 7805-70 ISO 4014
DIN 933 Болт с полной резьбой ГОСТ 7798-70
ГОСТ 7805-70 ISO 4017
DIN 933 SZ Болт с прямым шлицем ГОСТ 7798-70
ГОСТ 7805-70 ISO 4017
DIN 934 Гайка с крупной резьбой ГОСТ 5915-70
ГОСТ 5927-70
ГОСТ 10605-94
ГОСТ 15526-70 ISO 4032
ISO 4033
DIN 934 Гайка с мелким шагом резьбы ISO 8673
DIN 934 Гайка с левой резьбой
DIN 935 Гайка корончатая ГОСТ 5918-73
ГОСТ 5932-73
DIN 936 Гайка низкая ГОСТ 5916-70 ISO 4035
ISO 8675
DIN 937 Гайка корончатая низкая ГОСТ 5919-73
ГОСТ 5933-73
DIN 938 Шпилька резьбовая, ввинчиваемый конец ~ 1d ГОСТ 22033-76
DIN 939 Шпилька резьбовая, ввинчиваемый конец ~ 1. 25d ГОСТ 22034-76
ГОСТ 22035-76
DIN 940 Шпилька резьбовая, ввинчиваемый конец ~ 2.5d
DIN 960 Болт с мелкой неполной резьбой ГОСТ 7798-70
ГОСТ 7805-70
ГОСТ 15589-70 ISO 8765
DIN 961 Болт с мелким шагом резьбы ГОСТ 7798-70
ГОСТ 7805-70
ГОСТ 15589-70 ISO 8676
DIN 962 Стандарт на размеры отверстий в болтах ISO 7378
DIN 963 Винт с потайной головкой ГОСТ 17475-80 ISO 2009
DIN 964 Винт с полупотайной головкой ГОСТ 17474-80 ISO 2010
DIN 965 Винт потай, крестообразный шлиц ГОСТ 17475-80 ISO 7046-1
ISO 7046-2
DIN 965 Винт с потайной головкой Torx ГОСТ 17475-80 ISO 7046-1
ISO 7046-2
DIN 966 Винт с полупотайной головкой, шлиц PН ГОСТ 17474-80 ISO 7047
DIN 966 Винт с полупотайной головкой, шлиц PZ ГОСТ 17474-80 ISO 7047
DIN 967 Винт с полукруглой головкой и прессшайбой ГОСТ 11644-75
DIN 968 Шуруп-саморез с полукруглой головкой
DIN 970 Гайка с крупной и мелкой резьбой ISO 4032
DIN 971 Гайка с метрической мелкой резьбой ISO 8673
ISO 8674
DIN 975 Шпилька резьбовая метровая
DIN 976-1 Шпилька (штанга) резьбовая метровая
DIN 976-1-В Шпилька резьбовая форма В
DIN 976 Резьбовая шпилька (GS)
DIN 977 Гайка приварная ISO 21670
DIN 979 Гайка корончатая низкая
DIN 980 Гайка самостопорящаяся ISO 7042
ISO 7719
ISO 10513
DIN 981 Гайка круглая шлицевая
DIN 982 Гайка самоконтрящаяся ISO 7040
ISO 10512
DIN 983 Кольцо стопорное наружное
DIN 984 Кольцо стопорное внутреннее
DIN 985 Гайка самоконтрящаяся ISO 10511
DIN 986 Гайка колпачковая самоконтрящаяся
DIN 988 Шайба регулировочная
DIN 1052 Шайба строительная
DIN 1142 Зажим канатный, тросовый
DIN 1433 Палец цилиндрический
DIN 1434 Палец цилиндрический с уменьшенной головкой
DIN 1435 Палец цилиндрический с головкой
DIN 1436 Палец цилиндрический с головкой
DIN 1440 Шайба усиленная ISO 8738
DIN 1441 Шайба усиленная
DIN 1443 Штифт цилиндрический ISO 2340
DIN 1444 Штифт цилиндрический с головкой ISO 2341
DIN 1445 Болт с уменьшенной плоской двухгранной головкой и цапфой
DIN 1469 Штифт просечной цилиндрический с шейкой
DIN 1470 Штифт цилиндрический насечённый с направляющей частью ISO 8739
DIN 1471 Штифт конический насеченный по всей длине ISO 8744
DIN 1472 Штифт конический насеченный на 1/2 длины ISO 8745
DIN 1473 Штифт цилиндрический с тремя насечками по всей длине и фаской ISO 8740
DIN 1474 Штифт забивной цилиндрический с насечкой 1/2 длины с утолщением ISO 8741
DIN 1475 Штифт цилиндрический с насечкой 1/3 длины посредине ISO 8742
DIN 1476 Штифт цилиндрический с полукруглой головкой и насечкой ISO 8746
DIN 1477 Штифт с потайной головкой и насечкой ISO 8747
DIN 1478 Талреп вилка-вилка
DIN 1479 Гайка-муфта стяжная
DIN 1480 SPRH Талреп крюк — кольцо
DIN 1480 SPRR Талреп кольцо — кольцо
DIN 1480 SPHH Талреп крюк — крюк
DIN 1481 Штифт пружинный, разрезной, трубчатый с фаской ГОСТ 14229-93 ISO 8752
DIN 1587 Гайка колпачковая ГОСТ 11860-85
DIN 1804 Гайка шлицевая круглая ГОСТ 11871-88
DIN 1816 Гайка круглая с радиальными отверстиями
DIN 2093 Пружина тарельчатая ГОСТ 3057-90
DIN 2510 Гайка для шпилек
DIN 3017 Хомут червячный ГОСТ 28191-89
DIN 3052 Трос стальной 1х7 (1+6)
DIN 3053 Трос (канат) стальной 1х19
DIN 3055 Трос стальной 6х7+FC
DIN 3060 Канат (трос) стальной 6х19+FC ГОСТ 3070-88
DIN 3061 Канат стальной
DIN 3066 Канат с сердечником 6х37+FC
DIN 3093 Зажим-втулка для тросов
DIN 3570 Болт-скоба U-образный
DIN 5299 C Карабин пожарный
DIN 5299 D Карабин с фиксатором
DIN 5406 Шайба многолапчатая ГОСТ 11872-89
DIN 5685 A Цепь короткозвенная
DIN 5685 C Цепь длиннозвенная
DIN 5686 Цепь витая
DIN 6303 Гайка с накаткой
DIN 6304 Винт верстачный (воротковый)
DIN 6319 Шайба сферическая ГОСТ 13438-68
DIN 6319 Шайба коническая
DIN 6325 Штифт цилиндрический закалённый ГОСТ 3128-70 ISO 8734
DIN 6330 Гайка высокая ГОСТ 15523-70
ГОСТ 15525-70
DIN 6331 Гайка с буртиком
DIN 6332 Шпилька стопорная с упорной цапфой
DIN 6334 Гайка-втулка удлиненная
DIN 6340 Шайба усиленная
DIN 6796 Шайба тарельчатая ISO 10670
DIN 6797 А Шайба зубчатая с внешними зубцами ГОСТ 10463-81
DIN 6797 I Шайба с внутренними зубцами ГОСТ 10462-81
DIN 6797 V Шайба упругая зубчатая ГОСТ 10464-81
DIN 6798 A Шайба стопорная с внешними зубцами ГОСТ 10463-81
DIN 6798 I Шайба зубчатая с внутренними зубцами ГОСТ 10462-81
DIN 6798 V Шайба стопорная вогнутая ГОСТ 10464-81
DIN 6799 Шайба упорная быстросъёмная ГОСТ 11648-75
DIN 6884 Шпонка клиновая с лыской ISO 2492
DIN 6885-1 Шпонка призматическая высокая ГОСТ 23360-78
DIN 6887 Шпонка клиновая врезная ISO 774
DIN 6888 Шпонка сегментная ГОСТ 24071-97 ISO 3912
DIN 6899 Коуш для троса
DIN 6900 Винты комбинированные с невыпадающими шайбами
DIN 6901 Винты самонарезающие с невыпадающими плоскими шайбами
DIN 6902 Плоские шайбы для комбинированных винтов
DIN 6904 Упругие шайбы для комбинированных винтов
DIN 6905 Пружинные шайбы для комбинированных винтов
DIN 6906 Шайбы пружинные с зубцами для комбинированных винтов
DIN 6907 Шайбы упругие фасонные с наружными зубцами для комбинированных винтов
DIN 6908 Шайбы упругие зажимные для комбинированных винтов
DIN 6911 Ключ торцевой для внутреннего шестигранника с направляющей
DIN 6912 Винт (болт) под шестигранник
DIN 6913 Шайба пружинная с защитным пояском
DIN 6914 Болт высокопрочный ГОСТ Р 52644-2006
ГОСТ 22353-77 ISO 7412
DIN 6915 Гайка с увеличенным размером под ключ ГОСТ Р 52645-2006 ISO 7414
DIN 6916 Шайба высокопрочная
DIN 6917 Шайба прямоугольная косая (уклон 14%)
DIN 6918 Шайба клиновая косая (уклон 8%)
DIN 6921 Болт с фланцем EN 1665
DIN 6922 Болт с фланцем и переходным хвостовиком ISO 4162
ISO 8104
DIN 6923 Гайка с фланцем ГОСТ Р 50592-93 ISO 4161
ISO 10663
EN 1661
DIN 6923 Гайка с насечкой ГОСТ Р 50592-93
DIN 6924 Гайка самоконтрящаяся c неметаллическим вкладышем ISO 7040
ISO 10512
DIN 6925 Гайка самоконтрящаяся цельнометаллическая ISO 7042
ISO 7719
ISO 10513
DIN 6926 Гайка самоконтрящаяся с фланцем EN 1663
DIN 6927 Гайка самоконтрящаяся с фланцем, цельнометаллическая ISO 7044
ISO 12126
EN 1664
DIN 7337 Заклёпка вытяжная с плоской головкой ISO 14589
ISO 15977 — 15984
ISO 16582 — 16584
DIN 7338A Заклёпка для накладок тормозной колодки и для накладок сцепления
DIN 7338B Заклёпка для накладок тормозной колодки и для накладок сцепления
DIN 7338C Заклёпка для накладок тормозной колодки и для накладок сцепления
DIN 7343 Штифт цилиндрический спиральный с фасками ISO 8750
DIN 7344 Штифт цилиндрический спиральный с фасками, для тяжелой работы ISO 8748
DIN 7346 Штифт пружинный цилиндрический с прорезью ISO 13337
DIN 7349 Шайба усиленная
DIN EN ISO 7380 Винт с полукруглой головкой ГОСТ ISO 7380-1-2014
ГОСТ ISO 7380-2-2014 ISO 7380
DIN 7500 Винты резьбовыдавливающие Taptite ISO 7085
DIN 7500 C Винт резьбовыдавливающий, цилиндрическая головка со сферой, крестообразный шлиц
DIN 7500 D Винт резьбовыдавливающий, шестигранная головка с фланцем
DIN 7500 M Винт резьбовыдавливающий, потайная головка, шлиц Pz
DIN 7504 К Саморез с шестигранной головкой с фланцем
DIN 7504 M (N) Саморез по металлу со сверлом
DIN 7504 P Саморез-сверло
DIN 7513 A Винт самонарезающий с шестигранной головкой
DIN 7513 B Винт самонарезающий с цилиндрической головкой
DIN 7513 F Винт самонарезающий с потайной головкой
DIN 7513 G Винт самонарезающий с полупотайной головкой
DIN 7516 Винт самонарезающий ГОСТ 10619-80
ГОСТ 10620-80
ГОСТ 10621-80
DIN 7603 Кольцо уплотнительное
DIN 7604 Пробка резьбовая с шестигранной головкой и фланцем
DIN 7964 Винт невыпадающий ГОСТ 10337-80
ГОСТ 10338-80
DIN 7965 Муфта мебельная резьбовая
DIN 7967 Гайка стопорная (контргайка)
DIN 7968 Болт с гайкой, прецизионный
DIN 7969 Винт с гайкой
DIN 7971 Саморез-шуруп с цилиндрической головкой ISO 1481
DIN 7972 Саморез с потайной головкой ISO 1482
DIN 7973 Саморез с полупотайной головкой ISO 1483
DIN 7976 Саморез с шестигранной головкой ISO 1479
DIN 7977 Штифт конический с резьбовой цапфой ISO 8737
DIN 7978 Штифт конический с внутренней резьбой ГОСТ 9464-79 ISO 8736
DIN 7979 Штифт цилиндрический с внутренней резьбой ISO 8733
ISO 8735
DIN 7980 Шайба пружинная ГОСТ 6402-70
DIN 7981 Саморез с полукруглой головкой с крестообразным шлицем ГОСТ 10621-80
ГОСТ 11650-80 ISO 7049
DIN 7981 Саморез со шлицем Torx с полукруглой головкой ISO 14585
DIN 7982 Саморез с потайной головкой ГОСТ 10619-80
ГОСТ 11652-80 ISO 7050
ISO 14586
DIN 7983 Саморезы по металлу, полупотайная головка ГОСТ 10620-80
ГОСТ 11651-80 ISO 7051
DIN 7984 Винт высокопрочный с цилиндрической головкой и внутренним шестигранником ГОСТ 11738-84
DIN 7985 Винт с цилиндрической головкой и крестообразным шлицем ГОСТ 17473-80 ISO 7045
DIN 7985 ISR Винт с цилиндрической головкой Torx ГОСТ 17473-80 ISO 14583
DIN 7989 Шайба толстая
DIN 7991 Винт с потайной головкой и внутренним шестигранником ISO 10642
DIN 7992 Болт фундаментный с увеличенной T-образной головкой
DIN 7993 A Кольцо стопорное наружное
DIN 7993 B Кольцо стопорное внутреннее
DIN 7995 Шуруп по дереву с полупотайной головкой
DIN 7996 Шуруп по дереву с полукруглой головкой
DIN 7997 Шуруп по дереву с потайной головкой
DIN 7999 Болт призонный DIN 7999 заменён на DIN EN 14399-8
DIN 9021 Шайба кузовная ГОСТ 6958-78 ISO 7093-1
ISO 7093-2
DIN 9841 Винт с утолщенным стержнем ГОСТ 28962-91 ISO 7379
DIN 11023 Шплинт (штифт) с кольцом
DIN 11024 Шплинт пружинный, игольчатый
DIN EN 14399-8 Болт призонный
DIN 15237 Болт норийный
DIN 22424 Болт с трехгранной головкой и буртиком
DIN 22425 Гайка трехгранная с буртиком
DIN 28129 Гайка с кольцом
DIN 32501 Болт приварной
DIN 80704 Гайка-барашек закрытого типа
DIN 82101 Скоба такелажная
Вебинар
: Использование анализа Iso-Seq для создания лучшей аннотации
Соглашение об использовании изображения
Загружая, копируя или используя изображения, размещенные на этом веб-сайте («Сайт»), вы подтверждаете, что прочитали, поняли и согласны с условиями настоящего Соглашения об использовании изображений, а также с условиями, приведенными на веб-страницу Юридические уведомления, которые вместе регулируют использование вами изображений, как указано ниже. Если вы не согласны с такими условиями, не загружайте, не копируйте и не используйте изображения каким-либо образом, если у вас нет письменного разрешения, подписанного уполномоченным представителем Pacific Biosciences.
В соответствии с условиями настоящего Соглашения и условиями, приведенными на веб-странице Юридических уведомлений (в той степени, в которой они не противоречат условиям настоящего Соглашения), вы можете использовать изображения на Сайте исключительно для (а) редакционного использования в прессе. и / или отраслевых аналитиков, (б) в связи с обычной рецензируемой научной публикацией, книгой или презентацией и т.п. Вы не можете изменять или модифицировать любое изображение, полностью или частично, по любой причине. Вы не можете использовать какое-либо изображение, искажающее представление о связанных продуктах, услугах или технологиях Pacific Biosciences или о любых связанных характеристиках, данных или их свойствах.Вы также не можете использовать какое-либо изображение способом, который обозначает какое-либо представление или гарантию (явную, подразумеваемую или установленную законом) от Pacific Biosciences в отношении продукта, услуги или технологии. Права, предоставленные настоящим Соглашением, являются личными для вас и не могут быть переданы вами другой стороне.
Вы, а не Pacific Biosciences, несете ответственность за использование изображений. Вы признаете и соглашаетесь с тем, что любое неправильное использование изображений или нарушение настоящего Соглашения нанесет компании Pacific Biosciences непоправимый вред.Pacific Biosciences является владельцем или лицензиатом изображения, но не агентом владельца. Вы соглашаетесь предоставить Pacific Biosciences следующую кредитную линию: «Предоставлено Pacific Biosciences of California, Inc., Менло-Парк, Калифорния, США», а также включаете любые другие кредиты или благодарности, отмеченные Pacific Biosciences. Вы должны включить любое уведомление об авторских правах, изначально включенное в изображения, на всех копиях.
ИЗОБРАЖЕНИЙ ПРЕДОСТАВЛЯЮТСЯ Pacific Biosciences «КАК ЕСТЬ». Pacific Biosciences ОТКАЗЫВАЕТСЯ ОТ ВСЕХ ЗАЯВЛЕНИЙ И ГАРАНТИЙ, ЯВНЫХ, ПОДРАЗУМЕВАЕМЫХ ИЛИ ЗАКОНОДАТЕЛЬНЫХ УСЛОВИЙ, ВКЛЮЧАЯ, НО НЕ ОГРАНИЧИВАЯСЬ НАРУШЕНИЕМ, СОБСТВЕННОСТЬЮ, КОММЕРЧЕСКОЙ ЦЕННОСТЬЮ И ПРИГОДНОСТЬЮ ДЛЯ ОПРЕДЕЛЕННОЙ ЦЕЛИ. НИ ПРИ КАКИХ ОБСТОЯТЕЛЬСТВАХ Pacific Biosciences НЕ НЕСЕТ ОТВЕТСТВЕННОСТИ ЗА ЛЮБЫЕ ПРЯМЫЕ, КОСВЕННЫЕ, СЛУЧАЙНЫЕ, КОСВЕННЫЕ ИЛИ КОСВЕННЫЕ УБЫТКИ ЛЮБОГО ТИПА, КАКИЕ-ЛИБО В ОТНОШЕНИИ ИЗОБРАЖЕНИЙ.
Вы соглашаетесь с тем, что Pacific Biosciences может прекратить ваш доступ и использование изображений, размещенных на веб-сайте PacificBiosciences.com, в любое время и без предварительного уведомления, если компания сочтет, что вы нарушили какое-либо из условий настоящего Соглашения об использовании изображений. Вы соглашаетесь возмещать, защищать и оградить Pacific Biosciences, ее должностных лиц, директоров, сотрудников, агентов, лицензиаров, поставщиков и любых сторонних поставщиков информации на Сайт от всех убытков, расходов, убытков и издержек, включая разумные гонорары адвокатам. в результате любого нарушения вами условий настоящего Соглашения об использовании изображений или прекращения Pacific Biosciences вашего доступа к Сайту или его использования.Прекращение действия не повлияет на права Pacific Biosciences или ваши обязательства, которые возникли до прекращения.
Учебное пособие: приложение для анализа Iso-Seq [SMRT Link v6.0.0]
Соглашение об использовании изображения
Загружая, копируя или используя изображения, размещенные на этом веб-сайте («Сайт»), вы подтверждаете, что прочитали, поняли и согласны с условиями настоящего Соглашения об использовании изображений, а также с условиями, приведенными на веб-страницу Юридические уведомления, которые вместе регулируют использование вами изображений, как указано ниже.Если вы не согласны с такими условиями, не загружайте, не копируйте и не используйте изображения каким-либо образом, если у вас нет письменного разрешения, подписанного уполномоченным представителем Pacific Biosciences.
В соответствии с условиями настоящего Соглашения и условиями, приведенными на веб-странице Юридических уведомлений (в той степени, в которой они не противоречат условиям настоящего Соглашения), вы можете использовать изображения на Сайте исключительно для (а) редакционного использования в прессе. и / или отраслевых аналитиков, (б) в связи с обычной рецензируемой научной публикацией, книгой или презентацией и т.п.Вы не можете изменять или модифицировать любое изображение, полностью или частично, по любой причине. Вы не можете использовать какое-либо изображение, искажающее представление о связанных продуктах, услугах или технологиях Pacific Biosciences или о любых связанных характеристиках, данных или их свойствах. Вы также не можете использовать какое-либо изображение способом, который обозначает какое-либо представление или гарантию (явную, подразумеваемую или установленную законом) от Pacific Biosciences в отношении продукта, услуги или технологии. Права, предоставленные настоящим Соглашением, являются личными для вас и не могут быть переданы вами другой стороне.
Вы, а не Pacific Biosciences, несете ответственность за использование изображений. Вы признаете и соглашаетесь с тем, что любое неправильное использование изображений или нарушение настоящего Соглашения нанесет компании Pacific Biosciences непоправимый вред. Pacific Biosciences является владельцем или лицензиатом изображения, но не агентом владельца. Вы соглашаетесь предоставить Pacific Biosciences следующую кредитную линию: «Предоставлено Pacific Biosciences of California, Inc., Менло-Парк, Калифорния, США», а также включаете любые другие кредиты или благодарности, отмеченные Pacific Biosciences.Вы должны включить любое уведомление об авторских правах, изначально включенное в изображения, на всех копиях.
ИЗОБРАЖЕНИЙ ПРЕДОСТАВЛЯЮТСЯ Pacific Biosciences «КАК ЕСТЬ». Pacific Biosciences ОТКАЗЫВАЕТСЯ ОТ ВСЕХ ЗАЯВЛЕНИЙ И ГАРАНТИЙ, ЯВНЫХ, ПОДРАЗУМЕВАЕМЫХ ИЛИ ЗАКОНОДАТЕЛЬНЫХ УСЛОВИЙ, ВКЛЮЧАЯ, НО НЕ ОГРАНИЧИВАЯСЬ НАРУШЕНИЕМ, СОБСТВЕННОСТЬЮ, КОММЕРЧЕСКОЙ ЦЕННОСТЬЮ И ПРИГОДНОСТЬЮ ДЛЯ ОПРЕДЕЛЕННОЙ ЦЕЛИ. НИ ПРИ КАКИХ ОБСТОЯТЕЛЬСТВАХ Pacific Biosciences НЕ НЕСЕТ ОТВЕТСТВЕННОСТИ ЗА ЛЮБЫЕ ПРЯМЫЕ, КОСВЕННЫЕ, СЛУЧАЙНЫЕ, КОСВЕННЫЕ ИЛИ КОСВЕННЫЕ УБЫТКИ ЛЮБОГО ТИПА, КАКИЕ-ЛИБО В ОТНОШЕНИИ ИЗОБРАЖЕНИЙ.
Вы соглашаетесь с тем, что Pacific Biosciences может прекратить ваш доступ и использование изображений, размещенных на веб-сайте PacificBiosciences. com, в любое время и без предварительного уведомления, если компания сочтет, что вы нарушили какое-либо из условий настоящего Соглашения об использовании изображений. Вы соглашаетесь возмещать, защищать и оградить Pacific Biosciences, ее должностных лиц, директоров, сотрудников, агентов, лицензиаров, поставщиков и любых сторонних поставщиков информации на Сайт от всех убытков, расходов, убытков и издержек, включая разумные гонорары адвокатам. в результате любого нарушения вами условий настоящего Соглашения об использовании изображений или прекращения Pacific Biosciences вашего доступа к Сайту или его использования.Прекращение действия не повлияет на права Pacific Biosciences или ваши обязательства, которые возникли до прекращения.
секвенирования полноразмерных транскриптов (Iso-Seq) — CD Genomics
CD Genomics имеет большой опыт в предоставлении услуг Iso-Seq путем создания полноразмерных транскриптов без сборки. После каждой процедуры выполняется строгий контроль качества, чтобы гарантировать полные и точные результаты.
Введение Iso-Seq
У эукариотических организмов один ген может кодировать удивительное количество белков после альтернативного сплайсинга, каждый из которых выполняет свою биологическую функцию.Известны гены человека, которые выполняют очень разные функции в зависимости от того, какой вариант сплайсинга экспрессируется. С альтернативным сплайсингом, столь важным для функционирования генома.
Short-read RNA-Seq работает путем физического разделения изоформ транскриптов на более мелкие части и повторной сборки, оставляя возможности для неправильной сборки или неполного захвата всего разнообразия изоформ из интересующих генов. Важно делать полные стенограммы. Используя преимущества технологии секвенирования длинных считываний PacBio SMRT, секвенирование изоформ (Iso-Seq) может легко охватить полный транскрипт от 5 ‘конца до 3’-поли A-хвоста без необходимости фрагментации для получения полноразмерных последовательностей кДНК, что полезно для идентификации новых транскриптов и новых интронов, таким образом, точно идентифицируя изоформы, альтернативные сайты сплайсинга, экспрессию слитого гена и аллельную экспрессию.
По сравнению с платформой Illumina, анализ PacBio может легко обнаруживать очень длинные полицистронные молекулы РНК (называемые сложными транскриптами) и выявлять большое количество новых транскрипционных перекрытий между соседними и удаленными генами, расположенными параллельно. Полезно повысить возможность изучения общегеномной сети, осуществляющей совместный контроль над экспрессией и репликацией генов.
Рабочий процесс проекта
Требования к образцам:
Количество РНК: Общая РНК ≥ 5 мкг (без деградации или загрязнения ДНК)
Чистота РНК: OD260 / 280 = 1.8 ~ 2.2; OD260 / 230 ≥ 1,5
Качество РНК: 28S: 18S ≥ 1,5 ， RIN ≥ 7
Стратегия секвенирования:
Платформы PacBio, тип библиотеки> 4K, 6 ~ 10 Гб / образец
Анализ данных
Транскриптом без ссылки
Стандартный анализ данных
Полноразмерный анализ изоформы, включая коррекцию изоформы полной длины, классификацию, уменьшенную избыточность
Аннотации транскриптома
, включая онтологию генов, путь KEGG, KOG или COG, Swissport
Анализ генных структур, включая альтернативный сплайсинг, LncRNA, SSR, CDS
Расширенный анализ данных
Карта для ссылки
Анализ уровня экспрессии генов
Анализ дифференциально экспрессируемых генов
Анализ обогащения по KEGG с дифференциально экспрессируемым транскриптомом
Тепловая карта дифференциально экспрессируемого гена
… (больше по запросу)
Транскриптом со ссылкой
Стандартный анализ данных
Полноразмерный анализ изоформы, включая картирование эталонного генома, полноразмерную коррекцию изоформы, классификацию, уменьшенную избыточность
Аннотации транскриптома
, включая онтологию генов, путь KEGG, KOG или COG, Swissport
Анализ генных структур, включая альтернативный сплайсинг, LncRNA, SSR, CDS, предсказание нового транскриптома, идентификация слитого гена
Расширенный анализ данных
Карта для ссылки
Анализ уровня экспрессии генов
Анализ дифференциально экспрессируемых генов
Анализ обогащения по дифференциально экспрессируемому транскриптому KEGG.
Тепловая карта дифференциально экспрессируемого гена
… (больше по запросу)
Аналитический трубопровод
Длинное секвенирование позволяет напрямую идентифицировать альтернативно транскрибируемые или процессируемые транскрипты, полицистронные единицы транскрипции и другие длинные последовательности кДНК. Благодаря опыту и самоотдаче передовая платформа PacBio SMRT и услуги от CD Genomics станут вашим лучшим спутником в Iso-Seq. Пожалуйста, свяжитесь с нами для получения дополнительной информации и подробного предложения.
* Только для исследовательских целей. Не использовать в диагностических процедурах.
Утилита PacBio Iso-Seq для обнаружения транскриптов и генов в латексе гевеи
1.
An D, Cao H, Li C, Humbeck K, Wang W (2018) Секвенирование изоформ и современные приложения для разгадки сложности транскриптомы растений. Гены 9 (1): 43
Google ученый
2.
Berthelot K, Lecomte S, Estevez Y, Peruch F (2014) Hevea brasiliensis REF (Hev b 1) и SRPP (Hev b 3): обзор белков резиновых частиц.Биохимия 106: 1–9
CAS Google ученый
3.
Bokma E, Barends T, Terwissch van Scheltingab AC, Dijkstr BW, Beintema JJ (2000) Ферментная кинетика гевамина, хитиназы каучукового дерева Hevea brasiliensis . FEBS Lett 478: 119–122
CAS Google ученый
4.
Bokma E, Rozeboom HJ, Sibbald M, Dijkstra BW, Beintema JJ (2002) Экспрессия и характеристика мутантов активного сайта гевамина, хитиназы из каучукового дерева Hevea brasiliensis . Eur J Biochem 269: 893–901
CAS Google ученый
5.
Bokma E, Spiering M, Chow KS, Mulder PP, Subroto T, Beintema JJ (2001) Определение последовательностей кДНК и геномной ДНК гевамина, хитиназы из каучукового дерева Hevea brasiliensis . Plant Physiol Biochem 39: 367–376
CAS Google ученый
6.
Bokma E, van Koningsveld GA, Jeronimus-Stratingh M, Beintema JJ (1997) Гевамин, хитиназа из каучукового дерева Hevea brasiliensis , расщепляет пептидогликан между C-1 из N -ацетил C-4 из N -ацетилмурамовая кислота и, следовательно, не является лизоцимом.FEBS Lett 411 (2–3): 161–163
CAS Google ученый
org/ScholarlyArticle»> 7.
Камачо К., Кулурис Г., Авагян В., Ма Н., Пападопулос Дж., Билер К., Мэдден Т.Л. (2009) BLAST +: архитектура и приложения. BMC Bioinform 10: 421
Google ученый
8.
Chao J, Chen Y, Wu S, Tian WM (2015) Сравнительный анализ транскриптома латекса из клона каучукового дерева CATAS8-79 и PR107 обнаруживает новые сигналы для регуляции регенерации латекса и продолжительности потока латекса.BMC Plant Biol 15 (1): 104
Google ученый
9.
Cheng B, Furtado A, Henry RJ (2017) Длительное секвенирование транскриптома кофейных зерен показывает разнообразие полноразмерных транскриптов. Gigascience 6 (11): gix86
Google ученый
org/ScholarlyArticle»> 10.
Чоу К.С., Ван К.Л., Мат Иса М.Н., Бахари А., Тан С.Х., Харикришна К., Йанг Х.Й. (2007) Анализ биосинтеза каучука на основе анализа транскриптома латекса Hevea brasiliensis .J Exp Bot 58: 2429–2440
CAS Google ученый
11.
Chow KS, Mat Isa MN, Bahari A, Ghazali AK, Alias H, Mohd-Zainuddin Z, Hoh CC, Wan KL (2012) Метаболические пути, влияющие на биосинтез каучука в латексе Hevea brasiliensis . J Exp Bot 63: 1863–1871
CAS Google ученый
12.
Chow KS, Ghazali AK, Hoh CC, Mohd-Zainuddin Z (2014) Требование глубины чтения секвенирования РНК для оптимального охвата транскриптомом в Hevea brasiliensis .BMC Res Notes 7:69
Google ученый
org/ScholarlyArticle»> 13.
Conesa A, Gotz S, Garcia-Gomez JM, Terol J, Talon M, Robles M (2005) Blast2GO: универсальный инструмент для аннотации, визуализации и анализа в исследованиях функциональной геномики. Биоинформатика 21: 3674–3676
CAS Google ученый
14.
Dong L, Liu H, Zhang J, Yang S, Kong G, Chu JSC, Chen N, Wang D (2015) Одномолекулярное секвенирование транскриптов в реальном времени облегчает аннотацию генома мягкой пшеницы и исследование транскриптома зерна.BMC Genom 16: 1039
Google ученый
15.
Duan C, Argout X, Gébelin V, Summo M, Dufayard JF, Leclercq J, Piyatrakul P, Pirrello J, Rio M, Champion A, Montoro P (2013) Идентификация суперсемейства Hevea brasiliensis AP2 / ERF путем секвенирования РНК. BMC Genom 14 (1): 30
CAS Google ученый
16.
Филичкин С.А., Гамильтон М., Дхармавардхана П.Д., Сингх С.К., Салливан С., Бен-Гур А., Редди А.С., Джайсвал П. (2018) Абиотические стрессы модулируют ландшафт транскриптома тополя посредством альтернативного сплайсинга, дифференциального удержания интронов и переключение соотношения изоформ.Фронтальный завод Sci 12 (9): 5
Google ученый
17.
Gordon SP, Tseng E, Salamov A, Zhang J, Meng X, Zhao Z, Kang D, Underwood J, Grigoriev IV, Figueroa M, Schilling JS, Chen F, Wang Z (2015) Широко распространенные полицистронные расшифровки у грибов выявлено путем секвенирования мРНК одной молекулы. PLoS One 10: e0132628
Google ученый
org/ScholarlyArticle»> 18.
Goyvaerts E, Dennis M, Light D., Chua NH (1991) Клонирование и секвенирование кДНК, кодирующей фактор удлинения каучука Hevea brasiliensis .Физиология растений 97 (1): 317–321
CAS Google ученый
19.
Hoang NV, Furtado A, Mason PJ, Marquardt A, Kasirajan L, Thirugnanasambandam PP, Botha FC, Henry RJ (2017) Обзор сложного транскриптома из высокополиплоидного генома сахарного тростника с использованием полноразмерного изоформного секвенирования и сборка de novo из короткой последовательности чтения. BMC Genom 18 (1): 395
Google ученый
20.
Huelsenbeck JP, Ronquist F (2001) MRBAYES: Байесовский вывод филогенетических деревьев. Биоинформатика 17 (8): 754–755
CAS Google ученый
org/ScholarlyArticle»> 21.
Jekel PA, Hartmann BH, Beintema JJ (1991) Первичная структура гевамина, фермента с лизоцим-хитиназной активностью из латекса Hevea brasiliensis . Eur J Biochem 200: 123–130
CAS Google ученый
22.
Jiao WB, Schneeberger K (2017) Влияние геномных технологий третьего поколения на сборку генома растений. Curr Opin Plant Biol 36: 64–70
CAS Google ученый
23.
Jo IH, Lee J, Hong C, Lee D, Bae W, Park SG, Ahn Y, Kim Y, Kim J, Lee J, Hyun D (2017) Секвенирование изоформ дает более полное представление о panax ginseng транскриптом. Гены 8 (9): 228
Google ученый
org/ScholarlyArticle»> 24.
Ko JH, Chow KS, Han KH (2003) Анализ транскриптома показывает новые особенности молекулярных событий, происходящих в латициферах Hevea brasiliensis (пара каучуковое дерево). Plant Mol Biol 53: 479–492
CAS Google ученый
25.
Лау Н.С., Макита Ю., Кавашима М., Тейлор Т.Д., Кондо С., Осман А.С., Чонг АСК, Мацуи М. (2016) Геном каучукового дерева показывает расширение семейства генов, связанного с биосинтезом каучука.Научный представитель 6: 28594
CAS Google ученый
26.
Li C, Lin F, An D, Wang W, Huang R (2017) Секвенирование и сборка генома с помощью длинных считываний в растениях. Гены 9 (1): 6
Google ученый
org/ScholarlyArticle»> 27.
Li Y, Wei W, Feng J, Luo H, Pi M, Liu Z, Kang C (2017) Повторная аннотация генома дикой земляники Fragaria vesca с использованием обширной РНК на основе Illumina и SMRT -seq наборы данных.ДНК Res 25 (1): 61–70
Google ученый
28.
Liu JP, Xia ZQ, Tian XY, Li YJ (2015) Секвенирование транскриптома и анализ каучукового дерева ( Hevea brasiliensis, Muell.) Для обнаружения предполагаемых генов, связанных с сухостью панелей постукивания (TPD). BMC Genom 16 (1): 398
Google ученый
29.
Lopez D, Amira MB, Brown D, Muries B, Brunel-Michac N, Bourgerie S, Porcheron B, Lemoine R, Chrestin H, Mollison E, Di Cola A, Frigerio L, Julien JL, Gousset- Dupont A, Fumanal B, Label P, Pujade-Renaud V, Auguin D, Venisse JS (2016) Подсемейство аквапоринов Hevea brasiliensis XIP: геномные, структурные и функциональные характеристики, имеющие отношение к интенсивному сбору латекса. Plant Mol Biol 91: 375–396
CAS Google ученый
30.
Mantello CC, Cardoso-Silva CB, Da Silva CC, De Souza LM, Scaloppi EJ Jr, de Goncalves PS, Vicentini R, De Souza AP (2014) Сборка De novo и анализ транскриптома каучукового дерева ( Hevea brasiliensis ) и разработка маркеров SNP для путей биосинтеза каучука. PLoS One 9: e102664
Google ученый
31.
Montoro P, Wu S, Favreau B, Herlinawati E, Labrune C, Martin-Magniette ML, Pointet S, Rio M, Leclercq J, Ismawanto S (2018) Анализ транскриптома в латексе Hevea brasiliensis выявил изменения в сигнальных путях гормонов во время Этефонная стимуляция и последующее высыхание панели постукивания. Научный доклад 8 (1): 8483
Google ученый
org/ScholarlyArticle»> 32.
Oh SK, Kang H, Shin DH, Yang J, Chow KS, Yeang HY, Wagner B, Breiteneder H, Han KH (1999) Выделение, характеристика и функциональный анализ нового клона кДНК, кодирующего небольшой белок частиц каучука из Hevea brasiliensis .J Biol Chem 274 (24): 17132–17138
CAS Google ученый
33.
Pertea M, Kim D, Pertea GM, Leek JT, Salzberg SL (2016) Анализ экспрессии на уровне транскрипта в экспериментах с последовательностью РНК с HISAT, StringTie и Ballgown. Nat Protoc 11: 1650–1667
CAS Google ученый
34.
Pootakham W, Sonthirod C, Naktang C, Ruang-Areerate P, Yoocha T, Sangsrakru D, Theerawattanasuk K, Rattanawong R, Lekawipat N, Tangphatsornruang Some (2017) показывает гибридную сборку каучукового дерева De novo свидетельства палеотетраплоидии у гевей видов. Научный представитель 7: 41457
CAS Google ученый
35.
Roberts RJ, Carneiro MO, Schatz MC (2013) Преимущества секвенирования SMRT. Геном Биол 14 (6): 405
Google ученый
36.
Roberts A, Trapnell C, Donaghey J, Rinn JL, Pachter L (2011) Улучшение оценок экспрессии RNA-Seq путем корректировки смещения фрагментов. Геном Биол 12: R22
CAS Google ученый
37.
Робинсон Дж. Т., Торвальдсдоттир Х, Винклер В., Гутман М., Ландер Э. С., Гетц Г., Месиров Дж. П. (2011) Программа для просмотра интегративной геномики. Nat Biotechnol 29 (1): 24
CAS Google ученый
org/ScholarlyArticle»> 38.
Ronquist F, Teslenko M, Van Der Mark P, Ayres DL, Darling A, Höhna S, Larget B, Liu L, Suchard MA, Huelsenbeck JP (2012) MrBayes 3.2: эффективный байесовский филогенетический вывод и выбор модели в большом пространстве модели. Syst Biol 61 (3): 539–542
Google ученый
39.
Rozeboom HJ, Budiani A, Beintema JJ, Dijkstra BW (1990) Кристаллизация гевамина, фермента с лизоцим-хитиназной активностью из латекса Hevea brasiliensis . J Mol Biol 212: 441–443
CAS Google ученый
40.
Salgado LR, Koop DM, Pinheiro DG, Rivallan R, Le Guen V, Nicolás MF, De Almeida LG, Rocha VR, Magalhães M, Gerber AL, Figueira A (2014) De novo анализ транскриптома Hevea brasiliensis с помощью РНК-секвенирования и скрининга молекулярных маркеров. BMC Genom 15 (1): 236
Google ученый
41.
Schulz MH, Zerbino DR, Vingron M, Birney E (2012) Oases: надежная сборка de novo РНК-seq в динамическом диапазоне уровней экспрессии. Биоинформатика 28: 1086–1092
CAS Google ученый
42.
Sievers F, Wilm A, Dineen D, Gibson TJ, Karplus K, Li W, Lopez R, McWilliam H, Remmert M, Söding J, Thompson JD (2011) Быстрое масштабируемое производство высококачественного белка множественное выравнивание последовательностей с использованием Clustal Omega.Мол Сист Биол 7 (1): 539
Google ученый
43.
Симау Ф. А., Уотерхаус Р.М., Иоаннидис П., Кривенцева Е.В., Здобавов Е.М. (2015) БУСКО: оценка сборки генома и полноты аннотаций с помощью ортологов с единственной копией. Биоинформатика 31: 3210–3212
Google ученый
44.
Subroto T, van Koningsveld GA, Schreuder HA, Soedjanaatmadja UM, Beintema JJ (1996) Хитиназа и β-1,3-глюканаза во фракции лютоидных тел латекса Hevea .Фитохимия 43 (1): 29–37
CAS Google ученый
45.
Tan D, Hu X, Fu L, Kumpeangkeaw A, Ding Z, Sun X, Zhang J (2017) Сравнительный анализ морфологии и транскриптома выявляет различные функции первичных и вторичных клеток латицифера в каучуковом дереве. Научный доклад 7 (1): 3126
Google ученый
org/ScholarlyArticle»> 46.
Tang C, Xiao X, Li H, Fan Y, Yang J, Qi J, Li H (2013) Сравнительный анализ латексного транскриптома показывает предполагаемые молекулярные механизмы, лежащие в основе сверхпродуктивности Hevea brasiliensis .PLoS One 8: e75307
CAS Google ученый
47.
Тан Ц, Ян М, Фанг Y, Ло И, Гао С, Сяо Х, Ан З, Чжоу Б, Чжан Б, Тан Х, Йанг Х., Цинь И, Ян Дж, Линь Q, Мэй Х , Montoro P, Long X, Qi J, Hua Y, He Z, Sun M, Li W, Zeng X, Cheng H, Liu Y, Yang J, Tian W, Zhuang N, Zeng R, Li D, He P, Li Z, Zou Z, Li S, Li C, Wang J, Wei D, Lai CQ, Luo W, Yu J, Hu S, Huang H (2016) Геном каучукового дерева позволяет по-новому взглянуть на производство каучука и адаптацию видов.Nat Plants 2: 16073
CAS Google ученый
org/ScholarlyArticle»> 48.
Terwisscha van Scheltinga AC, Hennig M, Dijkstra BW (1996) Структура разрешения 1,8 A гевамина, растительной хитиназы / лизоцима и анализ консервативных последовательностей и структурных мотивов семейства гликозилгидролаз 18. J Mol Биол 262: 243–257
CAS Google ученый
49.
Terwisscha van Scheltinga AC, Kalk KH, Beintema JJ, Dijkstra BW (1994) Кристаллические структуры гевамина, защитного белка растений с хитиназной и лизоцимной активностью, а также его комплекса с ингибитором.Структура 2: 1181–1189
CAS Google ученый
50.
Thorvaldsdóttir H, Robinson JT, Mesirov JP (2013) Integrative Genomics Viewer (IGV): высокопроизводительная визуализация и исследование данных геномики. Краткий Биоинформ 14 (2): 178–192
Google ученый
51.
Trapnell C, Hendrickson DG, Sauvageau M, Goff L, Rinn JL, Pachter L (2013) Дифференциальный анализ регуляции генов при разрешении транскриптов с помощью RNA-seq.Nat Biotechnol 31: 46–53
CAS Google ученый
52.
Tungngoen K, Viboonjun U, Kongsawadworakul P, Katsuhara M, Julien JL, Sakr S, Chrestin H, Narangajavana J (2011) Гормональная обработка коры каучуковых деревьев ( Hevea brasiliensis ) разведение латекса в связи с дифференциальной экспрессией двух генов аквапоринов. J Plant Physiol 168 (3): 253–262
CAS Google ученый
org/ScholarlyArticle»> 53.
Wang B, Tseng E, Regulski M, Clark TA, Hon T, Jiao Y, Lu Z, Olson A, Stein JC, Ware D (2016) Раскрытие сложности транскриптома кукурузы с помощью одномолекулярного долгого чтения секвенирования. Nat Commun 7: 11708
CAS Google ученый
54.
Wang M, Wang P, Liang F, Ye Z, Li J, Shen C, Pei L, Wang F, Hu J, Tu L, Lindsey K (2018) Глобальный обзор альтернативного сращивания аллополиплоидного хлопка : ландшафт, сложность и регуляция.New Phytol 217 (1): 163–178
Google ученый
55.
Wu TD, Watanabe CK (2005) GMAP: программа геномного картирования и выравнивания последовательностей мРНК и EST. Биоинформатика 21: 1859–1875
CAS Google ученый
org/ScholarlyArticle»> 56.
Xia Z, Xu H, Zhai J, Li D, Luo H, He C, Huang X (2011) Анализ РНК-Seq и сборка транскриптома de novo Hevea brasiliensis .Завод Мол Биол 77: 299–308
CAS Google ученый
57.
Yuan Y, Bayer PE, Batley J, Edwards D (2017) Улучшения в геномных технологиях: применение в геномике сельскохозяйственных культур. Trends Biotechnol 35 (6): 547–558
CAS Google ученый
58.
Zerbino DR (2010) Использование ассемблера velvet de novo для технологий короткого чтения. Curr Protoc Bioinform 31 (1): 11.5.1–11.5.12
Google ученый
59.
Чжан В., Циклитира П., Мессинг Дж. (2013) Секвенирование семейств генов с помощью PacBio — тематическое исследование с генами глютена пшеницы. Ген 533: 541–546
Google ученый
60.
Zhang G, Sun M, Wang J, Lei M, Li C, Zhao D, Huang J, Li W, Li S, Li J, Yang J (2019) Полноразмерное секвенирование кДНК PacBio, интегрированное с РНК -seq reads значительно улучшает обнаружение транскриптов сплайсинга в рисе.Завод J 97 (2): 296–305
CAS Google ученый
61.
Zhu C, Li X, Zheng J (2018) Профилирование транскриптомов с использованием последовательности РНК острого перца на основе Illumina и SMRT для более глубокого понимания генов, участвующих в инфекции CMV. Ген 666: 123–133
CAS Google ученый
org/ScholarlyArticle»> 62.
Zou Z, Gong J, An F, Xie G, Wang J, Mo Y, Yang L (2015) Полногеномная идентификация каучукового дерева ( Hevea brasiliensis Muell.Arg.) Гены аквапоринов и их ответ на стимуляцию этефоном в латицифере, ткани, продуцирующей каучук. BMC Genom 16: 1001
Google ученый
63.
Zuo C, Blow M, Sreedasyam A, Kuo RC, Ramamoorthy GK, Torres-Jerez I, Li G, Wang M, Dilworth D, Barry K, Udvardi M (2018) Выявление транскриптомической сложности просо Последовательность длинных считываний PacBio. Биотехнология Биотопливо 11 (1): 170
Google ученый
Секвенирование РНК — PacBio
Соглашение об использовании изображения
Загружая, копируя или используя изображения, размещенные на этом веб-сайте («Сайт»), вы подтверждаете, что прочитали, поняли и согласны с условиями настоящего Соглашения об использовании изображений, а также с условиями, приведенными на веб-страницу Юридические уведомления, которые вместе регулируют использование вами изображений, как указано ниже. Если вы не согласны с такими условиями, не загружайте, не копируйте и не используйте изображения каким-либо образом, если у вас нет письменного разрешения, подписанного уполномоченным представителем Pacific Biosciences.
В соответствии с условиями настоящего Соглашения и условиями, приведенными на веб-странице Юридических уведомлений (в той степени, в которой они не противоречат условиям настоящего Соглашения), вы можете использовать изображения на Сайте исключительно для (а) редакционного использования в прессе. и / или отраслевых аналитиков, (б) в связи с обычной рецензируемой научной публикацией, книгой или презентацией и т.п.Вы не можете изменять или модифицировать любое изображение, полностью или частично, по любой причине. Вы не можете использовать какое-либо изображение, искажающее представление о связанных продуктах, услугах или технологиях Pacific Biosciences или о любых связанных характеристиках, данных или их свойствах. Вы также не можете использовать какое-либо изображение способом, который обозначает какое-либо представление или гарантию (явную, подразумеваемую или установленную законом) от Pacific Biosciences в отношении продукта, услуги или технологии. Права, предоставленные настоящим Соглашением, являются личными для вас и не могут быть переданы вами другой стороне.
Вы, а не Pacific Biosciences, несете ответственность за использование изображений. Вы признаете и соглашаетесь с тем, что любое неправильное использование изображений или нарушение настоящего Соглашения нанесет компании Pacific Biosciences непоправимый вред. Pacific Biosciences является владельцем или лицензиатом изображения, но не агентом владельца. Вы соглашаетесь предоставить Pacific Biosciences следующую кредитную линию: «Предоставлено Pacific Biosciences of California, Inc., Менло-Парк, Калифорния, США», а также включаете любые другие кредиты или благодарности, отмеченные Pacific Biosciences.Вы должны включить любое уведомление об авторских правах, изначально включенное в изображения, на всех копиях.
ИЗОБРАЖЕНИЙ ПРЕДОСТАВЛЯЮТСЯ Pacific Biosciences «КАК ЕСТЬ». Pacific Biosciences ОТКАЗЫВАЕТСЯ ОТ ВСЕХ ЗАЯВЛЕНИЙ И ГАРАНТИЙ, ЯВНЫХ, ПОДРАЗУМЕВАЕМЫХ ИЛИ ЗАКОНОДАТЕЛЬНЫХ УСЛОВИЙ, ВКЛЮЧАЯ, НО НЕ ОГРАНИЧИВАЯСЬ НАРУШЕНИЕМ, СОБСТВЕННОСТЬЮ, КОММЕРЧЕСКОЙ ЦЕННОСТЬЮ И ПРИГОДНОСТЬЮ ДЛЯ ОПРЕДЕЛЕННОЙ ЦЕЛИ. НИ ПРИ КАКИХ ОБСТОЯТЕЛЬСТВАХ Pacific Biosciences НЕ НЕСЕТ ОТВЕТСТВЕННОСТИ ЗА ЛЮБЫЕ ПРЯМЫЕ, КОСВЕННЫЕ, СЛУЧАЙНЫЕ, КОСВЕННЫЕ ИЛИ КОСВЕННЫЕ УБЫТКИ ЛЮБОГО ТИПА, КАКИЕ-ЛИБО В ОТНОШЕНИИ ИЗОБРАЖЕНИЙ.
Вы соглашаетесь с тем, что Pacific Biosciences может прекратить ваш доступ и использование изображений, размещенных на веб-сайте PacificBiosciences.com, в любое время и без предварительного уведомления, если компания сочтет, что вы нарушили какое-либо из условий настоящего Соглашения об использовании изображений. Вы соглашаетесь возмещать, защищать и оградить Pacific Biosciences, ее должностных лиц, директоров, сотрудников, агентов, лицензиаров, поставщиков и любых сторонних поставщиков информации на Сайт от всех убытков, расходов, убытков и издержек, включая разумные гонорары адвокатам. в результате любого нарушения вами условий настоящего Соглашения об использовании изображений или прекращения Pacific Biosciences вашего доступа к Сайту или его использования.Прекращение действия не повлияет на права Pacific Biosciences или ваши обязательства, которые возникли до прекращения.
Расшифровка очень похожих транскриптов мультигенных семейств из данных Iso-Seq с помощью IsoCon
Обзор IsoCon
Входными данными для алгоритма IsoCon является набор считываний PacBio CCS, по крайней мере, с одним полным прохождением транскрипта, и их базовые прогнозы качества. IsoCon предполагает, что считывания были предварительно обработаны биоинформатическим конвейером Iso-Seq для удаления праймеров, штрих-кодов и считываний, которые являются химерами или не охватывают весь транскрипт.На этапе предварительной обработки считывания разделяются в соответствии с парами праймеров, используемыми для амплификации отдельных семейств генов, и IsoCon запускается отдельно для каждого семейства генов. Результатом IsoCon является набор транскриптов, которые являются результатом исправления ошибок чтения и сообщения о каждом отдельном чтении.
IsoCon состоит из двух основных этапов: (i) итеративный алгоритм кластеризации для исправления ошибок считывания и определения транскриптов-кандидатов, и (ii) итеративное удаление статистически не значимых кандидатов.
На этапе кластеризации / исправления считываемые данные разбиваются на кластеры, при этом считывания, которые схожи сгруппированными, объединяются в один кластер. Для каждого кластера вычисляется множественное выравнивание и согласованная последовательность. Затем считывания в каждом кластере частично корректируются с учетом согласованной последовательности кластера; чтобы избежать удаления истинных вариантов, исправляется только половина потенциально ошибочных столбцов. Затем процесс повторяется — измененные операции чтения повторно разделяются на потенциально другие кластеры и снова корректируются.Этот процесс повторяется до тех пор, пока не перестанут обнаруживаться различия в каком-либо кластере, а оставшиеся различные последовательности будут называться транскриптами-кандидатами (или просто кандидатами).
Шаг кластеризации / исправления разработан так, чтобы быть чувствительным, и поэтому за ним следует второй шаг, который удаляет возможные транскрипты, которые недостаточно поддерживаются исходными (нескорректированными) считываниями. Первоначально исходные чтения назначаются одному из наиболее подходящих кандидатов. Затем, оценивая все пары близких кандидатов, для каждой пары мы проверяем, есть ли достаточные доказательства того, что назначенные им чтения на самом деле не происходят из одного и того же транскрипта.Для этого мы берем двух кандидатов и набор вариантов позиций (то есть позиций, где два кандидата различаются) и формулируем тест гипотезы, чтобы сделать вывод, насколько вероятно, что считывания, поддерживающие эти варианты, вызваны ошибками секвенирования. Поскольку кандидат может участвовать во многих парных тестах, ему присваивается наименьшее значащее значение p из всех выполненных парных тестов. После проверки всех пар кандидатов часть несущественных кандидатов будет удалена.Затем повторяется второй шаг IsoCon — исходные чтения назначаются наиболее подходящему из оставшихся кандидатов, которые затем подвергаются статистической проверке. Это продолжается до тех пор, пока все оставшиеся кандидаты не станут значительными. Остальные кандидаты затем выводятся в виде предсказанных стенограмм.
Этап кластеризации и исправления ошибок
Во-первых, нам нужно определить концепцию ближайших соседей и графа ближайших соседей. Пусть dist ( x , y ) обозначает расстояние редактирования между двумя строками x и y .Пусть S будет множественным набором строк. Для строки x мы говорим, что y ∈ S является ближайшим соседом x в S , если \ ({\ mathrm {dist}} \ left ({x, y} \ right ) = \ mathop {{{\ mathrm {min}}}} \ limits_ {z \ in S} {\ mathrm {dist}} \ left ({x, z} \ right) \). То есть y имеет наименьшее расстояние до x в S . Граф ближайших соседей S является ориентированным графом, в котором вершинами являются строки S , и существует ребро от x до y тогда и только тогда, когда y является ближайшим соседом x , но не x .
Есть две фазы на этапе кластеризации / коррекции — фаза разделения и фаза коррекции — и мы выполняем итерацию между фазами. На этапе разделения мы сначала разделяем операции чтения на кластеры, причем каждый кластер имеет ровно одно чтение, обозначаемое как центр. Идея состоит в том, что каждый раздел содержит предполагаемый набор чтений, исходящих из одного и того же транскрипта, а центр — это чтение, последовательность которого наиболее похожа на последовательность транскрипта. Для разбиения мы сначала строим граф G , который изначально идентичен графу ближайшего соседа, построенному из считываний.Затем мы идентифицируем чтение x в G с наибольшим числом вершин, которое может достигать x . Мы создаем новый кластер с x в качестве центра и содержащий все чтения в G , которые имеют путь к x , включая сам x . Затем мы удаляем элементы нового кластера вместе с их краями из G . Затем мы перебираем только что измененный G : определяем вершину с наибольшим числом вершин, которые могут ее достичь, и создаем кластер с центром вокруг нее. Полный псевдокод дается в алгоритме PartitionStrings на дополнительном рисунке 9.
Результирующий раздел имеет свойство, заключающееся в том, что каждая строка имеет одного из ближайших соседей (не включая себя) в своем кластере. Этот ближайший сосед может быть центром, но не обязательно. Таким образом, кластер может содержать много строк, которые являются ближайшими соседями других, но только одна из них обозначается как центр.
Фаза коррекции работает независимо с каждым кластером чтения и его соответствующим центром.Сначала мы создаем попарные выравнивания от каждого чтения до центра, используя парашют ⁶⁰. Затем мы создаем матрицу множественного выравнивания A из попарных выравниваний (подробности см. В дополнительном примечании 1). Каждая запись в A — это либо нуклеотид, либо символ пробела, и каждая строка соответствует считыванию. Мы получаем консенсус A , выбирая наиболее частый символ в каждом столбце. Каждую ячейку в A затем можно охарактеризовать как одно из четырех состояний по отношению к консенсусу: замена, вставка, удаление или совпадение. t \), а поддержка ячейки в A — это поддержка состояния этой ячейки в столбце этой ячейки. Поддержка зависит от состояния, чтобы быть более чувствительной к различным типам ошибок. Например, поскольку удаления и вставки являются частыми, необходимо большее покрытие, чтобы эти варианты не корректировались, по сравнению с заменой. Затем при каждом чтении мы идентифицируем вариантные позиции (т.е. чье состояние — замещение, вставка или удаление) и выбираем половину этих позиций, которые имеют наименьшую поддержку.Затем для каждой из этих позиций мы исправляем ее до наиболее часто встречающегося символа в столбце; но если наиболее частый символ не является уникальным, то исправление не производится.
Шаг кластеризации / коррекции IsoCon объединяет этапы разделения и коррекции следующим образом. Первоначально мы разбиваем набор чтений и исправляем каждый кластер. Считается, что кластер сошелся, если все его строки идентичны. Пока хотя бы один кластер не сойдется, мы повторяем этапы разбиения и исправления. Чтобы гарантировать, что в конечном итоге все кластеры сойдутся, мы эвристически отменяем исправление строки, если после исправления она имеет большее расстояние редактирования до центра, чем это было до ее центра в предыдущей итерации, если строка чередуется между разделами в циклическом режиме. мода, или один и тот же набор строк неоднократно назначается одному и тому же разделу, где они различаются только в позициях, где не определен наиболее частый символ. Наконец, после того, как все разделы сойдутся, мы назначаем их центры как транскрипты кандидатов и переходим к этапу фильтрации кандидатов IsoCon.Полный псевдокод для этого шага приведен в подпрограмме ClusterCorrect на дополнительном рисунке 9.
Шаг фильтрации кандидатов
Второй шаг IsoCon принимает в качестве входных данных набор считываний X и набор транскриптов кандидатов \ (C = \ {c_1, \ ldots, c_l \} \). Первый шаг — назначить чтения кандидатам, так что одно чтение назначается ровно одному из ближайших соседних кандидатов в C . Поскольку чтение может иметь несколько кандидатов ближайшего соседа в C , существует много возможных назначений.Для наших целей мы используем следующий итеративный жадный алгоритм. Для каждого чтения x ∈ X мы определяем его ближайших соседей-кандидатов в C . Затем мы выбираем кандидата c ∈ C , который является ближайшим соседом по наибольшему количеству считываний в X . Мы назначаем все эти чтения на c и удаляем c из C и все назначенные чтения из X . Затем мы повторяем процесс, используя уменьшенные X и C , пока не будут назначены все чтения.
Теперь у нас есть задание чтения кандидатам. Мы обозначаем X _i чтения, которые назначены кандидату c _i. Мы проверяем наличие доказательств, подтверждающих, что c _i является истинным кандидатом следующим образом. Мы рассматриваем кандидатов, которые являются ближайшими соседями c _i в \ (C — \ {c_i \} \). Затем для каждого кандидата ближайшего соседа c _j мы формируем нулевую гипотезу о том, что чтения в X _i и в X _j происходят из c 907 j , i.е. c _i не является истинным кандидатом. Расчет значения значимости согласно этой нулевой гипотезе приведен в следующем разделе. Мы вычисляем p _i, наименее значимое значение среди всех c _j. Мы ограничиваем наши сравнения c _i только его ближайшими соседями-кандидатами, потому что это сохраняет эффективность нашего алгоритма, и маловероятно, что сравнение с другими, более разнородными кандидатами увеличит p _i.
Затем мы идентифицируем кандидатов, у которых p _i больше порога значимости α . Этот α является параметром нашего алгоритма, по умолчанию установленным на 0,01. Затем эти кандидаты удаляются из набора кандидатов C . Для параметра τ , если имеется более τ кандидатов со значением значимости выше α , мы удаляем только верхние τ кандидатов с наивысшими значениями.Затем выполняется итерация этапа фильтрации кандидатов: мы снова назначаем чтения кандидатам и определяем кандидатов с недостаточной поддержкой в соответствии с нашим тестом гипотез. Алгоритм останавливается, когда больше нет кандидатов с p _i выше α . Псевдокод для этого алгоритма вместе со всем IsoCon приведен на дополнительном рисунке 9.
Статистический тест
Нам даны две кандидатуры транскриптов c, и d и наборы считываний X _c и X _d, которые были им назначены.Мы используем \ (x_i \ in X_c \ cup X_d \) для обозначения каждого чтения и позволяем n быть количеством чтений в \ (X_c \ cup X_d \). Мы вычисляем попарные выравнивания от \ (X_c \ cup X_d \ cup \ {c \} \) до d . Затем мы строим матрицу множественного выравнивания A из этих попарных выравниваний таким же образом, как и на этапе исправления (подробности см. В дополнительном примечании 1). Каждая запись в A соответствует либо нуклеотиду, либо символу пробела. Пусть V будет индексом столбцов A , где c и d не согласуются.Мы называем эти позиции вариантными.
Пусть A _{i, j} обозначает символ в столбце j строки i of A . Строки \ (1 \ le i \ le n \) соответствуют показаниям x _i, а строка n + 1 соответствует c . Для \ (1 \ le i \ le n \) мы определяем двоичную переменную S _i, которая равна 1 тогда и только тогда, когда A _{i, j} = A _{n +1, j} для всех j ∈ V .То есть S _i равно 1 тогда и только тогда, когда прочитано x _i поддерживает все варианты V , т. е. имеет те же символы, что и c в позициях V в А . Мы делаем следующие предположения:
1.
d , действующий как эталонная последовательность в этом тесте, не содержит ошибок.
2.
Нуклеотид в считываемой позиции, которая не находится в V и отличается от соответствующего нуклеотида в d , происходит из-за ошибки секвенирования. Другими словами, в позиции, где совпадают c и d , они не могут быть оба неправильными.
3.
Вероятности ошибки в двух разных позициях при чтении независимы.
4.
S _i и \ (S_ {i \ prime} \) являются независимыми случайными величинами для всех \ (i \ ne i \ prime \).
Наша нулевая гипотеза состоит в том, что позиции вариантов в A связаны с ошибками секвенирования в X . Чтобы вывести распределение S _i при нулевой гипотезе, нам сначала нужна вероятность, обозначенная как p _ij, что позиция j в считываемом i обусловлена ошибка.Это можно в значительной степени получить из оценок качества Phred при чтении (подробности см. В дополнительном примечании 1). При предположении 3 мы имеем, что S _i следует распределению Бернулли со средним значением \ (p_i = \ mathop {\ prod} \ limits_ {j \ in V} {p_ {ij}} \).
Соответствующая статистика теста при нулевой гипотезе — это величина, которая моделирует силу (или значимость) поддержки вариантов V . Мы хотели бы учитывать только те чтения, которые полностью поддерживают все варианты, т.е.е. читает x _i с s _i = 1 ( s _i обозначает наблюдаемое значение S _i). Эти считывания могут иметь ошибки в невариантных местоположениях, но в вариантных местоположениях они должны соответствовать c . Для каждого такого чтения мы хотели бы взвесить его вклад как величину, обратную вероятности того, что все символы в различных местоположениях являются результатом ошибок последовательности.{s_ {i}}}} \)
Обратите внимание, что p _i уменьшается с количеством вариантов в V и с более высокими базовыми показателями качества; следовательно, \ (T \) предназначен для использования связанных вариантов в транскрипте в том смысле, что для поддержки транскрипта требуется меньше операций чтения, когда в транскрипте больше вариантов. Более того, \ (p_i \) уменьшается для считываний с более высоким базовым качеством CCS в вариантных позициях, что означает, что для поддержки расшифровки требуется меньше операций чтения, если они имеют более высокое качество.Мы заметили, что значения качества оснований в CCS сильно варьировались и зависят от (i) количества проходов при считывании CCS, (ii) длины мононуклеотидов и (iii) секвенированного основания с C и G. с более низкими качествами, связанными с ними (дополнительный рис. 10)
Мы принимаем \ (t \) как наблюдаемое значение этой статистики и называем его взвешенной поддержкой. Учитывая \ (t \), мы вычисляем значение значимости как \ (P (T \ ge t) \). Мы используем односторонний тест, поскольку нас интересуют только значения значимости равной или более взвешенной поддержки для \ (V \).Мы не знаем о закрытой форме распределения \ (T \) при нулевой гипотезе, и метод грубой силы для вычисления \ (P (T \ ge t) \) был бы невозможен. Однако мы можем воспользоваться следующей теоремой из ссылки. ⁶¹, что дает замкнутую формулу, верхнюю границу распределения суммы случайных величин Бернулли:
Теорема: Пусть \ (a_1, \ ldots, a_n \) является вещественным числом в \ ((0, 1] \) и \ (Z_1, \ ldots, Z_n \) — случайные испытания Бернулли .n {\ frac {{p_i \ log \, p_i}} {{\ mathop {{{\ mathrm {max}}}} \ limits_k \ left ({- \ log \, p_k} \ right)}}} \)
Обратите внимание, что при этом преобразовании \ (P \ left ({T \ prime \ ge t \ prime} \ right) = P \ left ({T \ ge t} \ right) \), поскольку функция логарифмирования строго монотонный, а нормализация с использованием максимума постоянна. \ mu \)
Мы используем эту верхнюю границу как значение значимости.Обратите внимание, что теорема применима только для \ (\ delta> 0 \). Если \ (t \ prime \ le \ mu \), то это не так. Однако это означает, что наблюдаемая взвешенная поддержка ниже ожидаемой поддержки при нулевой гипотезе. Такие значения явно несущественны, и в нашем программном обеспечении по умолчанию установлено значение 0,5. Транскрипты-кандидаты, которые имеют более чем пороговое значение вариантных положений (по умолчанию 10) относительно всех других транскриптов-кандидатов, не оцениваются статистически, потому что их значение p будет почти равным 0.
Связь с ICE
IsoCon, как и ICE, использует итеративный кластерный и консенсусный подход, но эти два алгоритма имеют фундаментальные различия. После кластеризации IsoCon формирует взвешенный консенсус на основе профиля ошибок в разделе и использует его в качестве информации для исправления ошибок чтения; ICE, с другой стороны, получает кластерный консенсус, используя автономный вызывающий консенсус DAGCON ⁶², который будет использоваться в следующей итерации без исправления ошибок чтения. IsoCon и ICE также различаются графами, которые они используют для моделирования взаимосвязи между последовательностями, и алгоритмом разделения графа на кластеры. IsoCon детерминированно создает кластеры, моделируемые как проблема обхода пути, в то время как ICE моделирует кластер как максимальную клику и использует недетерминированный приближенный алгоритм максимальной клики. Возможно, наиболее важно то, что IsoCon, в отличие от ICE, включает статистическую структуру, которая позволяет отличать ошибки от истинных вариантов с более высокой точностью.
Экспериментальные методы
Поли (A) РНК была выделена из РНК семенников двух мужчин европеоидной расы (ID: CR560016, возраст 59 лет, образец 1; CR561118, возраст 79 лет, образец 2; Origene) с использованием набора Poly (A) Purist MAG ( Thermo Fisher Scientific). 50 нг поли (A) РНК на каждый образец вместе с 1 мкг контрольной тотальной РНК печени (использованной для контроля) использовали для создания двухцепочечной ДНК с использованием набора SMARTer PCR cDNA Synthesis Kit (Clontech). Была проведена оптимизация цикла ПЦР реакции амплификации кДНК с использованием праймера Clontech, и 12 циклов были определены как оптимальные для крупномасштабной амплификации ПЦР.Для каждого из девяти семейств ампликонических генов мы сконструировали пару праймеров RT-PCR с одним праймером, расположенным в первом, а другой праймером, расположенным в последнем, кодирующем экзоне (дополнительная таблица 4). Для одного из этих семейств генов ( CDY, ) была разработана дополнительная пара праймеров для захвата транскриптов, происходящих из всех копий гена (дополнительный рисунок 11). Один из двух уникальных штрих-кодов PacBio был добавлен к праймерам, чтобы различать продукты ОТ-ПЦР между двумя мужчинами. Затем продукты ОТ-ПЦР от этих двух индивидуумов были разделены на два эквимолярных пула в соответствии с ожидаемыми размерами транскриптов (<1 т.п.н. и 1-2 т.п.н.; дополнительная таблица 4) и очищены с использованием гранул AMPure XP (Beckman Coulter, Inc., СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ). Затем каждый из двух пулов ОТ-ПЦР использовали для создания отдельной библиотеки PacBio Iso-Seq, которую секвенировали на RSII (химия P6-C4) с использованием одной клетки SMRT на библиотеку. Таким образом, всего было секвенировано две клетки SMRT.
Кроме того, мы секвенировали те же продукты ОТ-ПЦР с помощью технологии Illumina. Мы создали отдельную библиотеку Nextera XT (с уникальной парой индексов) для каждой комбинации пара праймеров. Всего девять семейств генов были проанализированы с использованием 10 пар праймеров (как упомянуто выше, одно семейство генов, CDY , было проанализировано с двумя парами праймеров).Таким образом, было сконструировано 10 пар праймеров × 2 человека = 20 библиотек. Эти библиотеки были нормализованы, объединены в эквимолярном соотношении и секвенированы на приборе MiSeq с использованием одного набора MiSeq Reagent Nano Kit, v2 (250 × 250 секвенирование парных концов).
Расширенная версия экспериментального протокола доступна в Интернете по адресу https://doi. org/10.1038/protex.2018.109.
Доступность кода
IsoCon имеет открытый исходный код и находится в свободном доступе по адресу https://github.com/ksahlin/IsoCon. Результаты IsoCon в этой статье были получены с помощью коммита 79589f3 на GitHub.Подробная информация о параметрах программного обеспечения приведена в дополнительном примечании 4. Скрипты для всех анализов доступны по адресу https://github.com/ksahlin/IsoCon_Eval. Этот репозиторий также включает рабочий процесс snakemake ⁶³, который воспроизводит промежуточные и конечные данные для анализа семейства ампликонических генов.
Введение в метод Iso-Seq: секвенирование полноразмерных транскриптов
из блога PacBio
С недавним запуском SMRT Analysis v2.2, мы рады представить аналитическое программное обеспечение, поддерживающее новый метод Iso-Seq ™ для секвенирования полноразмерных транскриптов и изоформ генов без необходимости сборки! Сегодня мы более подробно рассмотрим метод Iso-Seq, чтобы объяснить его уникальную научную ценность, и рассмотрим публикации тех, кто уже применяет секвенирование одиночной молекулы в реальном времени (SMRT®) в этой захватывающей области исследований.
В геномах растений и животных, наряду со всеми высшими эукариотическими организмами, большинство генов подвергается альтернативному сплайсингу для получения изоформ множественных транскриптов. У людей, например, есть данные об альтернативном сплайсинге более 95% генов [1], в среднем более пяти изоформ на ген. Регулирование генов с помощью альтернативного сплайсинга может резко увеличить потенциал кодирования белков генома, который содержит ограниченное количество генов, кодирующих белки.Несколько удивительно, что альтернативно сплайсированные изоформы из одного гена также могут иметь очень разные, даже антагонистические, функции [2]. Следовательно, понимание функциональной биологии генома требует знания полного набора изоформ. Микромассивы и высокопроизводительное секвенирование кДНК стали невероятно полезными инструментами для изучения транскриптомов, однако эти технологии предоставляют небольшие фрагменты транскриптов, и создание полных транскриптов для изучения изоформ генов было сложной задачей.
Благодаря необычайно длинным считываниям, доступным при секвенировании PacBio®, новый метод Iso-Seq обеспечивает считывание полной длины, охватывающее все изоформы транскрипта от полиА-хвоста до 5′-конца.Больше нет необходимости реконструировать транскрипты или делать выводы изоформ на основе объединения локальной информации, поскольку каждая последовательность представляет собой отдельную полноразмерную молекулу кДНК. Этот метод сочетает в себе разрешение на уровне изоформ с лучшим секвенированием всего транскриптома, чтобы обеспечить прямое секвенирование изоформ гена по всему транскриптому. Мы рады сообщить, что теперь ученые используют метод Iso-Seq для рутинной секвенирования полноразмерных изоформ у самых разных организмов и применяют этот подход для улучшения аннотаций в эталонных геномах, характеристики изоформ генов в важных семействах генов и найти новые гены даже в наиболее изученных линиях клеток человека.
Вот избранный список последних публикаций, презентаций и примеров данных:
• Au et al. (2013) Характеристика транскриптома ESC человека с помощью гибридного секвенирования. PNAS 110: E4821-4830.
• Sharon et al. (2013) Одномолекулярный долгосрочный обзор человеческого транскриптома. Nature Biotechnol 31: 1009-1014.
• Thomas et al. (2014) Долгосрочное секвенирование куриных транскриптов и идентификация новых изоформ транскриптов. PLoS One.9: e94650.
• Treutlein et al. (2014) Картография альтернативного сплайсинга нейрексина, картированная с помощью секвенирования мРНК с длительным считыванием одной молекулы. PNAS 111: E1291-1299.
• Zhang et al. (2014) PacBio-секвенирование семейств генов — тематическое исследование с генами глютена пшеницы. Gen 533: 541-546.
• Бринзевич Д. и др. (2014) ВИЧ-1 взаимодействует с оболочками человеческого эндогенного ретровируса К (HML-2), полученными из первичных лимфоцитов человека. Журнал вирусологии 88: 6213-6223.
• П.Ларсен и др. (2012) Применение циклического консенсусного секвенирования и сетевого анализа для характеристики репертуара бычьего IgG.
Исо расшифровка: ИСО — Международная организация по стандартизации